RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 RAD18Q9NS91 495 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 ALS2Q96Q42 1657 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 C5P01031 1676 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 PRR23AA6NEV1 266 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 MAP2K7O14733 419 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 RAMP2O60895 175 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 GRK3P35626 688 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 CCL23P55773 120 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 TGM3Q08188 693 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 SLC39A12Q504Y0 691 aa14□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 PCDH9Q9HC56 1237 aa14□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 CDH9Q9ULB4 789 aa14□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 PMPCBO75439 489 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 SERPINB4P48594 390 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 INPP1P49441 399 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 SUSD6Q92537 303 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 FAM161BQ96MY7 647 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 ABCC13Q9NSE7 274 aa14□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 STX3Q13277 289 aa13.99□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 CDT1Q9H211 546 aa13.99□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 TP53BP2Q13625 1128 aa13.99□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 FAM83EQ2M2I3 478 aa13.99□□□□□ -0.17
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NISCH-207ENST00000479054 FOXR1Q6PIV2 292 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 SHISA4Q96DD7 197 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 HES6Q96HZ4 224 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 GRID1Q9ULK0 1009 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 GOLGA8TH3BQL2 631 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 TGM2P21980 687 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 PPP3CCP48454 512 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 NDUFV1P49821 464 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-207ENST00000479054 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
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