RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 FAM92AA1XBS5 289 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 CFAP69A5D8W1 941 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 NDC80O14777 642 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 SYN1P17600 705 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 KLRC2P26717 231 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ITGA8P53708 1063 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 CAV1Q03135 178 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 TAF10Q12962 218 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MTMR3Q13615 1198 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 P3H1Q32P28 736 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 TPGS2Q68CL5 300 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 RFX8Q6ZV50 586 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MREGQ8N565 214 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 GIPC2Q8TF65 315 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 CASP10Q92851 521 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ART4Q93070 314 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 RUFY1Q96T51 708 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 TMEM51Q9NW97 253 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 OSER1Q9NX31 292 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 IL37Q9NZH6 218 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 YIPF1Q9Y548 306 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.6□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MFSD11O43934 449 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 FGF18O76093 207 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MAP3K6O95382 1288 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 APOEP02649 317 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 RARGP13631 454 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ETS1P14921 441 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ITIH2P19823 946 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 AMPD1P23109 780 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 CCR1P32246 355 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ACTN2P35609 894 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 NR2C2P49116 596 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 PGFP49763 221 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 GDF10P55107 478 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 GBE1Q04446 702 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 GPS1Q13098 491 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 SEMA3BQ13214 749 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 DPYSQ14117 519 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 PPP2R5DQ14738 602 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 VEPH1Q14D04 833 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 HERVK_113Q902F9 699 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ZBP1Q9H171 429 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.59□□□□□ -1.03
COPS4-201ENST00000264389 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 I6L893 689 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 PRRG1O14668 218 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 TLL1O43897 1013 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 ABLIM3O94929 683 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 SEC24AO95486 1093 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 CSH1P0DML2 217 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 CSH2P0DML3 217 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 IVDP26440 423 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 ELF1P32519 619 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 SERPINB6P35237 376 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 GGCXP38435 758 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 ALDH1A3P47895 512 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 TBX4P57082 545 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 FAM193AP78312 1265 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 EFEMP1Q12805 493 aa8.58□□□□□ -1.04
COPS4-201ENST00000264389 XRCC4Q13426 336 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms