RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 TRPS1Q9UHF7 1281 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 FBXO10Q9UK96 956 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 ABCB11O95342 1321 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 NID2Q14112 1375 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 PTPRSQ13332 1948 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 USP34Q70CQ2 3546 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 H0Y858 1186 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 ADAMTS3O15072 1205 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 KNG1P01042 644 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 ATF2P15336 505 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 SMARCA1P28370 1054 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 TECP42680 631 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 FBXL16Q8N461 479 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 MYCT1Q8N699 235 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.51□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 COL20A1Q9P218 1284 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 TET1Q8NFU7 2136 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 APOL1O14791 398 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 LPXNO60711 386 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 DDCP20711 480 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.5□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.5□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 UIMC1Q96RL1 719 aa8.49□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 CD320Q9NPF0 282 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF69Q9UC07 566 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 SIP14410 1827 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 C5orf42Q9H799 3197 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PPC4 97 aa8.48□□□□□ -1.05
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ATG4D-210ENST00000588972 GPR32O75388 356 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 ITGB7P26010 798 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 HSPA7P48741 367 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 HSD17B4P51659 736 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 NCKAP1LP55160 1127 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4D-210ENST00000588972 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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