RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654		J3KTA2	159 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	GSTM5	P46439	218 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CFHR1	Q03591	330 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	SEMA3B	Q13214	749 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	ELF2	Q15723	593 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	SGCZ	Q96LD1	299 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	PRY	O14603	147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	PPEF2	O14830	753 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	DHH	O43323	396 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	MOSPD3	O75425	235 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	TACR3	P29371	465 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	THBS4	P35443	961 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	IDUA	P35475	653 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	RAB30	Q15771	203 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CNGA3	Q16281	694 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	SHC4	Q6S5L8	630 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	KRT73	Q86Y46	540 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	TNIP3	Q96KP6	325 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	FCRL5	Q96RD9	977 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CDC23	Q9UJX2	597 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	PCDH17	O14917	1159 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	INPPL1	O15357	1258 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	TAF5L	O75529	589 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	NDUFS1	P28331	727 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	C16orf89	Q6UX73	402 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CUL5	Q93034	780 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	MAFF	Q9ULX9	164 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	PIP5K1B	O14986	540 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	PLA2G6	O60733	806 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	PLAU	P00749	431 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	PEPD	P12955	493 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	ST6GAL1	P15907	406 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	DUSP1	P28562	367 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	GRM4	Q14833	912 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	ACSM6	Q6P461	480 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	NRAC	Q8N912	160 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	COQ8B	Q96D53	544 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GPHN-215	ENST00000557654	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	NPC1	O15118	1278 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	ITGA5	P08648	1049 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	PRF1	P14222	555 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	MMP8	P22894	467 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	SERPINB3	P29508	390 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	PTGER1	P34995	402 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	STAT6	P42226	847 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	AGTR2	P50052	363 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	ID2	Q02363	134 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	MTA1	Q13330	715 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	STIM1	Q13586	685 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC181	Q5TID7	509 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GPHN-215	ENST00000557654	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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