RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 RARRES1P49788 294 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 NTHL1P78549 312 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 NOTUMQ6P988 496 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PROSER1Q86XN7 944 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 MYADMQ96S97 322 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 KLC2Q9H0B6 622 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CSRNP2Q9H175 543 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 KCNH6Q9H252 994 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 WASF3Q9UPY6 502 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.58□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 INPPL1O15357 1258 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ADAM12O43184 909 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 NEMFO60524 1076 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 GLUD1P00367 558 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 XBP1P17861 261 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 NEK4P51957 841 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 DSC1Q08554 894 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 TFDP1Q14186 410 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ICAM4Q14773 271 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF174Q15697 407 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 FUT10Q6P4F1 479 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 TCP11Q8WWU5 503 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 NUDT11Q96G61 164 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 MTMR9Q96QG7 549 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CDC6Q99741 560 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 SNTG2Q9NY99 539 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CA14Q9ULX7 337 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CFAP54Q96N23 3096 aa7.57□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 I3L4J1 428 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 AQP7O14520 342 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PTGESO14684 152 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 TGM5O43548 720 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 KLHL18O94889 574 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 LTFP02788 710 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PFKPQ01813 784 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 DSG1Q02413 1049 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 TDGQ13569 410 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 GIT2Q14161 759 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 HS1BP3Q53T59 392 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 SPECC1Q5M775 1068 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PHF19Q5T6S3 580 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CD276Q5ZPR3 534 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CEP57Q86XR8 500 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 GDAQ9Y2T3 454 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.56□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CLUHO75153 1309 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A1B0GUA9 196 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 BLACEA4D250 179 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PP2D1A8MPX8 630 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CCL16O15467 120 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 GPR42O15529 346 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ASAP2O43150 1006 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 TADA2AO75478 443 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 RECQL4O94761 1208 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 LYPLA2O95372 231 aa7.55□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 KNG1P01042 644 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms