RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482419.1

FAM208B-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, human

TSL 2

Gene FAM208B, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208B-208	ENST00000482419	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	BRD3	Q15059	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	SEC23B	Q15437	767 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	FCHO1	O14526	889 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	PCDH17	O14917	1159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	NPC1	O15118	1278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	BCAR3	O75815	825 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	CDK4	P11802	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ALAD	P13716	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	NPPB	P16860	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ELF2	Q15723	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	CNGA3	Q16281	694 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419		A0A087WV62	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419		M0QZQ0	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ITGA5	P08648	1049 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	TACR3	P29371	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	GAB1	Q13480	694 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	MORC3	Q14149	939 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	GRM4	Q14833	912 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	PMM1	Q92871	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM208B-208	ENST00000482419	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	PRY	O14603	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	TP73	O15350	636 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	HOXD12	P35452	270 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	GHRHR	Q02643	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM208B-208	ENST00000482419	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms