RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 B3GALT6Q96L58 329 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM209Q96SK2 561 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 SMC4Q9NTJ3 1288 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 DTLQ9NZJ0 730 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 COL20A1Q9P218 1284 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXW11Q9UKB1 542 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 PNMA2Q9UL42 364 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 TELO2Q9Y4R8 837 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 STAB1Q9NY15 2570 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 NOTCH4Q99466 2003 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 MUSKO15146 869 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 FLRT2O43155 660 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 LRG1P02750 347 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 RHOP08100 348 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC96Q2M329 555 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 TEPPQ6URK8 271 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 Q8N1Y9 231 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 LCORLQ8N3X6 602 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D5Q92609 795 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 SMARCD2Q92925 531 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 GPRASP2Q96D09 838 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGGTB-203ENST00000459697 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR27A2RRH5 827 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 NRP1O14786 923 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 CHADO15335 359 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 AP5Z1O43299 807 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 PRKAB2O43741 272 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF623O75123 536 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 C1RP00736 705 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 ALDH2P05091 517 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXA9P31269 272 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 P2RY2P41231 377 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 DSG1Q02413 1049 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC158Q5M9N0 1113 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 STEAP3Q658P3 488 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 ENGASEQ8NFI3 743 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 LPPQ93052 612 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 MIB2Q96AX9 1013 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 TCEAL4Q96EI5 215 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 LGR4Q9BXB1 951 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 GAREM1Q9H706 876 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 PXMP2Q9NR77 195 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 SNTG2Q9NY99 539 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 MYLKQ15746 1914 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRK1Q38SD2 2015 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 DOCK5Q9H7D0 1870 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 ESYT2A0FGR8 921 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 RRN3P2A6NIE6 340 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 MTSS1O43312 755 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 DDAH2O95865 285 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 TGFB3P10600 412 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF33AQ06730 810 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNAB2Q13303 367 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 PLCB4Q15147 1175 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 TESK1Q15569 626 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-203ENST00000459697 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms