RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399207.5

SETD4-204, Transcript of SET domain containing 4, human

TSL 3 BASIC

Gene SETD4, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD4-204	ENST00000399207	TERB1	Q8NA31	727 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	BHMT	Q93088	406 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	BECN2	A8MW95	431 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	CAPN9	O14815	690 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	LATS1	O95835	1130 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	NCAM1	P13591	858 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	SLC11A2	P49281	568 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	MESP2	Q0VG99	397 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	CRY1	Q16526	586 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	LPAL2	Q16609	132 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	EMC10	Q5UCC4	262 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	PLK2	Q9NYY3	685 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	USP34	Q70CQ2	3546 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	RET	P07949	1114 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	TBX4	P57082	545 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	MYL5	Q02045	173 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	RING1	Q06587	406 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	BEND5	Q7L4P6	421 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	TMEM110	Q86TL2	294 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	UCMA	Q8WVF2	138 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	VPS16	Q9H269	839 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	LHX5	Q9H2C1	402 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF292	O60281	2723 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207		E5RJQ4	531 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	SGK1	O00141	431 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	TRIM24	O15164	1050 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	LRP3	O75074	770 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	UCHL3	P15374	230 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	NTSR1	P30989	418 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	HOXC13	P31276	330 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	CLCN1	P35523	988 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	PDCL	Q13371	301 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	NNT	Q13423	1086 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	KRT31	Q15323	416 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ELF2	Q15723	593 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	C11orf74	Q86VG3	221 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SETD4-204	ENST00000399207	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58

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