RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SSTR1P30872 391 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 GP5P40197 560 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 RFX3P48380 749 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 NSMCE2Q96MF7 247 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMCX1Q9P291 453 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D12O60347 775 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNMB4Q86W47 210 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 OOSP2Q86WS3 158 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CPNE1Q99829 537 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 VTNP04004 478 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 YY1P25490 414 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 NUMBP49757 651 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SPANXN3Q5MJ09 141 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 C4orf19Q8IY42 314 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 POU5F2Q8N7G0 328 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MYRFQ9Y2G1 1151 aa24.76■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 C2CD2LO14523 706 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TMC5Q6UXY8 1006 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ERO1BQ86YB8 467 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFAF1Q9Y375 327 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ALADP13716 330 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 HALP42357 657 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMC6P62333 389 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 POU6F1Q14863 301 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC4Q5T2S8 1044 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 B3GAT3O94766 335 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 EID3Q8N140 333 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SVOPQ8N4V2 548 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP41Q9BYV8 373 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PADI4Q9UM07 663 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CLOCKO15516 846 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM13O60858 407 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MGAT1P26572 445 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TALDO1P37837 337 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKAA2P54646 552 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 NEDD8Q15843 81 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 NFIL3Q16649 462 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DEPDC7Q96QD5 511 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PRRG3Q9BZD7 231 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SAR1AQ9NR31 198 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS18Q9NS28 235 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFP1Q6P2D0 407 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PGM2Q96G03 612 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP12Q9UNI6 340 aa24.75■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 INPP4BO15327 924 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 LRG1P02750 347 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TPH1P17752 444 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 EFEMP1Q12805 493 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM228AQ86W67 206 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DPY30Q9C005 99 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 RABGEF1Q9UJ41 708 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TK2O00142 265 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG7O95352 703 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 GNASQ5JWF2 1037 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM180AQ6UWF9 173 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGED4Q96JG8 741 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 H7C4K7 107 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 FSBPO95073 299 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PAX7P23759 505 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CAP2P40123 477 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH17Q12864 832 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 INAQ16352 499 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ALFQ53S48 1182 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TKTL1P51854 596 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 IRGCQ6NXR0 463 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MAML3Q96JK9 1138 aa24.74■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms