RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541102.1

LTBR-209, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LTBR, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-209ENST00000541102 GABBR2O75899 941 aa14.91□□□□□ -0.02
LTBR-209ENST00000541102 ZBED1O96006 694 aa14.91□□□□□ -0.02
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LTBR-209ENST00000541102 HMBSP08397 361 aa14.91□□□□□ -0.02
LTBR-209ENST00000541102 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
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LTBR-209ENST00000541102 MESP2Q0VG99 397 aa14.91□□□□□ -0.02
LTBR-209ENST00000541102 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LTBR-209ENST00000541102 PKDCCQ504Y2 493 aa14.91□□□□□ -0.02
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LTBR-209ENST00000541102 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.91□□□□□ -0.02
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LTBR-209ENST00000541102 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LTBR-209ENST00000541102 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
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LTBR-209ENST00000541102 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
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LTBR-209ENST00000541102 THAP12O43422 761 aa14.89□□□□□ -0.03
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LTBR-209ENST00000541102 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.89□□□□□ -0.03
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LTBR-209ENST00000541102 RNF139Q8WU17 664 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBR-209ENST00000541102 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBR-209ENST00000541102 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBR-209ENST00000541102 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBR-209ENST00000541102 EDEM1Q92611 657 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBR-209ENST00000541102 BHMTQ93088 406 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBR-209ENST00000541102 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.88□□□□□ -0.03
LTBR-209ENST00000541102 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.88□□□□□ -0.03
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