RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 PLK2Q9NYY3 685 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PTPRJQ12913 1337 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PPP1R37O75864 691 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 WISP1O95388 367 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TBX18O95935 607 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 C1SP09871 688 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CDK4P11802 303 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 GJB2P29033 226 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ACTN2P35609 894 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 DDIT3P35638 169 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CTSKP43235 329 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PGFP49763 221 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 COPAP53621 1224 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 RHDQ02161 417 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ENPP2Q13822 863 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 LY6DQ14210 128 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ERICH1Q86X53 443 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SFR1Q86XK3 245 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 RAD54LQ92698 747 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 HVCN1Q96D96 273 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 P2RY11Q96G91 374 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CALML4Q96GE6 196 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TMX3Q96JJ7 454 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 KCNK16Q96T55 309 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 96.1
ATG4B-222ENST00000491867 INTS13Q9NVM9 706 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 MYH10P35580 1976 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 NPC1O15118 1278 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TLR5O60602 858 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 C6P13671 934 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ACSL1P33121 698 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 UBA7P41226 1012 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SLC5A3P53794 718 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CDH8P55286 799 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.071e-5■■■□□ 17.8
ATG4B-222ENST00000491867 GEN1Q17RS7 908 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ACCSQ96QU6 501 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 LGMNQ99538 433 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 STRA6Q9BX79 667 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 IL37Q9NZH6 218 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 FBXO10Q9UK96 956 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 NBASA2RRP1 2371 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CKAP5Q14008 2032 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 A0A1B0GTQ1 180 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SLC28A2O43868 658 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 DFNA5O60443 496 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 FSBPO95073 299 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TNNC2P02585 160 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 GARTP22102 1010 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PRKCHP24723 683 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ACADVLP49748 655 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 UCMAQ8WVF2 138 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 BIRC7Q96CA5 298 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TACC1O75410 805 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SEMA4FO95754 770 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 EPHX1P07099 455 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CD27P26842 260 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 MFAP3P55082 362 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 C21orf59P57076 290 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF234Q14588 700 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PKDCCQ504Y2 493 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 LHX5Q9H2C1 402 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms