RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MGAT1P26572 445 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNJLQ8IV13 435 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCUBE1Q8IWY4 988 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR27A2RRH5 827 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNFSF9P41273 254 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINB8P50452 374 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF2BQ00403 316 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MGAT5Q09328 741 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEL1L3Q68CR1 1132 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP6NLQ92738 828 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM169Q96HH4 297 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM4CQ9H3R0 1056 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ROBO3Q96MS0 1386 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CKMP06732 381 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGS2P41220 211 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP3CCP48454 512 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTK2BQ14289 1009 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTXN3Q4LDR2 81 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPAMQ9HCL2 828 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP39A1Q9NYL5 469 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGA11Q9UKX5 1188 aa17.07■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CES2O00748 559 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC130P13994 396 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP3A7P24462 503 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MLH1P40692 756 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST8SIA6P61647 398 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNX17Q15036 470 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UGCGQ16739 394 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF180Q86T96 592 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC45BQ8IWX7 931 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SHC3Q92529 594 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PGM2Q96G03 612 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RXFP1Q9HBX9 757 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FMO1Q01740 532 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ILDR2Q71H61 639 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM71AQ8IYT1 594 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNX31Q8N9S9 440 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HTR3CQ8WXA8 447 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEMA4DQ92854 862 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC2A3P11169 496 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINB3P29508 390 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRADDP78560 199 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC27A1Q6PCB7 646 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PBX1P40424 430 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC11A2P49281 568 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMPD2Q01433 879 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STX5Q13190 355 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAMLD1Q13495 774 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPC2Q8N158 579 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa17.06■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF103O00237 685 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMB3Q13751 1172 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALNTL6Q49A17 601 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPNTQ6UXI9 565 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF711Q9Y462 761 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRF6O14896 467 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RECQL4O94761 1208 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCNN1BP51168 640 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VGLL4Q14135 290 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DMC1Q14565 340 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C16orf46Q6P387 395 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCT7Q99832 543 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPC5OSA6NMA1 111 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F5H5T6 163 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASS1P00966 412 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APOA4P06727 396 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCR1P32246 355 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OVOS1Q6IE37 1185 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNBD2Q96M20 576 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB1Q9HAE3 211 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GID8Q9NWU2 228 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LZTS1Q9Y250 596 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNX13Q9Y5W8 968 aa17.05■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FCHO1O14526 889 aa17.04■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOAT2O75908 522 aa17.04■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VAPBO95292 243 aa17.04■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFICP08651 508 aa17.04■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLK1P53350 603 aa17.04■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.04■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ECSITQ9BQ95 431 aa17.04■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DTNAQ9Y4J8 743 aa17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms