RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.15□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.15□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.15□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.15□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 ABCB11O95342 1321 aa7.14□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 ZNF529Q6P280 563 aa7.14□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.14□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 SP140Q13342 867 aa7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 FGL2Q14314 439 aa7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 SESTD1Q86VW0 696 aa7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 MAML1Q92585 1016 aa7.13□□□□□ -1.27
USP40-202ENST00000409945 NDC1Q9BTX1 674 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 RIPK3Q9Y572 518 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 DNERQ8NFT8 737 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 ZNF536O15090 1300 aa7.12□□□□□ -1.27
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USP40-202ENST00000409945 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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