RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDH8P55286 799 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 MORC3Q14149 939 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHPFQ8IZ52 775 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 NACA2Q9H009 215 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPRDP23468 1912 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 BICDL2A1A5D9 508 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SH3BP5O60239 455 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CAPNS1P04632 268 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASPAP45381 313 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 MIB1Q86YT6 1006 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CEP63Q96MT8 703 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNK16Q96T55 309 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SDCBP2Q9H190 292 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.832e-12■■■■■ 298.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 HCN2Q9UL51 889 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CACNA1EQ15878 2313 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITPR1Q14643 2758 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM24O15164 1050 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 NDUFS2O75306 463 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 IRF1P10914 325 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNSP15586 552 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 NDUFV2P19404 249 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 NELFBQ8WX92 580 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 FOXJ1Q92949 421 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 MED10Q9BTT4 135 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 COMMD8Q9NX08 183 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL37Q9NZH6 218 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 FASNP49327 2511 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 BMP6P22004 513 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC5A3P53794 718 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCAPQ12770 1279 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 CAMK4Q16566 473 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 UNC93AQ86WB7 457 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACOX2Q99424 681 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 GABRG3Q99928 467 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD248Q9HCU0 757 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 GMIPQ9P107 970 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 GJB3O75712 270 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 NDST1P52848 882 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 PAK1Q13153 545 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTI2Q6NXR4 508 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 HTR3DQ70Z44 454 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACOT1Q86TX2 421 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM35AQ86V20 835 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 NAXDQ8IW45 347 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 WBP2Q969T9 261 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 BBS2Q9BXC9 721 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAB20Q9NX57 234 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM92AA1XBS5 289 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 CACNG3O60359 315 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 TLR5O60602 858 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 TYRP14679 529 aa20.18■□□□□ 0.82
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