RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TMC2Q8TDI7 906 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MPP6Q9NZW5 540 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 RCN1Q15293 331 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 FAR2Q96K12 515 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ADM5C9JUS6 153 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MLH1P40692 756 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 FGD2Q7Z6J4 655 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TOMM70O94826 608 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PROSCO94903 275 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 THRAP10827 490 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 RNF19AQ9NV58 838 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRUQ92729 1446 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TBX4P57082 545 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CCNJLQ8IV13 435 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PHF21BQ96EK2 531 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TMCC3Q9ULS5 477 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 O00370 1275 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DSG3P32926 999 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 NFIL3Q16649 462 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TTI2Q6NXR4 508 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DSG1Q02413 1049 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 KCNMA1Q12791 1236 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DLC1Q96QB1 1528 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MTSS1LQ765P7 747 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D23Q9NUY8 699 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 BAIAP3O94812 1187 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 OR1E1P30953 314 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CCR1P32246 355 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 RGS5O15539 181 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SLC2A4P14672 509 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 WDR27A2RRH5 827 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TNNI3P19429 210 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MPP3Q13368 585 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DOK6Q6PKX4 331 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SV2AQ7L0J3 742 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DNERQ8NFT8 737 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA4DQ92854 862 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC130P13994 396 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNB3Q05901 458 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ENO4A6NNW6 628 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SLC26A2P50443 739 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MMRN1Q13201 1228 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ADORA2AP29274 412 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINB3P29508 390 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TGFB2P61812 414 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 EHD4Q9H223 541 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.271e-11■□□□□ 9.6
PTPRM-201ENST00000332175 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 EXD1Q8NHP7 514 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TUBP50607 506 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ACOX1Q15067 660 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ACTR8Q9H981 624 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MARC1Q5VT66 337 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CATSPER2Q96P56 530 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ACOT9Q9Y305 439 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CPA3P15088 417 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 VHLP40337 213 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TLK2Q86UE8 772 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CYP4Z1Q86W10 505 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DEFA1P59665 94 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DEFA3P59666 94 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 LACTBL1A8MY62 500 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PYGMP11217 842 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms