RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 MTFR1LQ9H019 292 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 AP4S1Q9Y587 144 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.19□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 VWA5AO00534 786 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGAP33O14559 1287 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ZBTB39O15060 712 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SNPHO15079 494 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TM9SF1O15321 606 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 MTA2O94776 668 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 GH1P01241 217 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 NFKBIAP25963 317 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ITGA8P53708 1063 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 GCNT1Q02742 428 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 CYP24A1Q07973 514 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 DMPKQ09013 629 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PTPRNQ16849 979 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PALM2Q8IXS6 379 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SKA1Q96BD8 255 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF302Q9NR11 478 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 CNTNAP1P78357 1384 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 FCHO1O14526 889 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 KLHL2O95198 593 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 COMTP21964 271 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 MAGEA4P43358 317 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 NEK3P51956 506 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 RAP1GDS1P52306 607 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 EFNA5P52803 228 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 OCA2Q04671 838 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PPATQ06203 517 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TFDP1Q14186 410 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 MTERF2Q49AM1 385 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TMC7Q7Z402 723 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ALLCQ8N6M5 410 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 C10orf82Q8WW14 230 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SHC3Q92529 594 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 RNF34Q969K3 372 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ATG4CQ96DT6 458 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 WRNIP1Q96S55 665 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 EBF3Q9H4W6 596 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 WBP1LQ9NX94 342 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 GIN1Q9NXP7 522 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 NENFQ9UMX5 172 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 MYPNQ86TC9 1320 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TM7SF2O76062 418 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 CYP1A2P05177 515 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 CYP11B1P15538 503 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PMLP29590 882 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 CPA2P48052 419 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 SLC18A1P54219 525 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 FOLH1Q04609 750 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 PPP3CAQ08209 521 aa6.18□□□□□ -1.42
SEH1L-210ENST00000592582 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms