RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 RPS6KB1P23443 525 aa8.57□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 AFMP43652 599 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 OAZ1P54368 228 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 CCL23P55773 120 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 BEX3Q00994 111 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 ITGA7Q13683 1181 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.57□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 SNX33Q8WV41 574 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.57□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 ASB14A6NK59 587 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 KLRF2D3W0D1 207 aa8.56□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.56□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 MAN2A1Q16706 1144 aa8.56□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.56□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.56□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 RNF146Q9NTX7 359 aa8.56□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 ISM1B1AKI9 464 aa8.55□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 ACTN1P12814 892 aa8.55□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 RSPH3Q86UC2 560 aa8.55□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.55□□□□□ -1.04
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ATG4D-210ENST00000588972 PAF1Q8N7H5 531 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 IFI44Q8TCB0 444 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 TMX3Q96JJ7 454 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 PIGSQ96S52 555 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4D-210ENST00000588972 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.55□□□□□ -1.04
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