RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SDCBP2Q9H190 292 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TGFB3P10600 412 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF132P52740 706 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ROR1Q01973 937 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PEX6Q13608 980 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MYBPC3Q14896 1274 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 LIN52Q52LA3 116 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SCUBE3Q8IX30 993 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TTC13Q8NBP0 860 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 NETO2Q8NC67 525 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PDE5AO76074 875 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ITGAVP06756 1048 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 IQCF3P0C7M6 154 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 FAM200BP0CF97 657 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF286BP0CG31 522 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 NDST1P52848 882 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CASC4Q6P4E1 433 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PCGF5Q86SE9 256 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 KIF12Q96FN5 646 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 FZD9O00144 591 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 C2CD2LO14523 706 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 P4HA1P13674 534 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ANPEPP15144 967 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 GPX6P59796 221 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 OCRLQ01968 901 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 LRRC38Q5VT99 294 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ACOT1Q86TX2 421 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TREML1Q86YW5 311 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 ANKRD27Q96NW4 1050 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 NDE1Q9NXR1 346 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 AK5Q9Y6K8 562 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 LPXNO60711 386 aa15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 GRIA2P42262 883 aa15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 PHKA2P46019 1235 aa15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SPATA24Q86W54 205 aa15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 XYLT1Q86Y38 959 aa15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 RILPQ96NA2 401 aa15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 VCX3BQ9H321 246 aa15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.58■□□□□ 0.09
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM63AO94886 807 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZBED1O96006 694 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GSTA2P09210 222 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PDGFRBP09619 1106 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 BCAR1P56945 870 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DSG1Q02413 1049 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RASA2Q15283 850 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SLC26A7Q8TE54 656 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SIX4Q9UIU6 781 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CDC16Q13042 620 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PTK7Q13308 1070 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DPYSL3Q14195 570 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PANX3Q96QZ0 392 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 FAM155BO75949 473 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CYP2C8P10632 490 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TTLL4Q14679 1199 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ACAP1Q15027 740 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SLC35B2Q8TB61 432 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ECSITQ9BQ95 431 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms