RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tarsl2Q8BLY2 790 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tspan3Q9QY33 253 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mup6A2AV72 179 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Unc13dB2RUP2 1085 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm8257E9Q8R3 264 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tekt5G5E8A8 557 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 H2-Eb1P04230 264 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CapslQ6P8Y1 208 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 DcstampQ7TNJ0 470 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q80WR5 230 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slitrk1Q810C1 696 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ifi44Q8BV66 422 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Haus3Q8QZX2 570 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mapre2Q8R001 326 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vangl2Q91ZD4 521 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tomm70Q9CZW5 611 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Scgb2b21A0A087WQA9 112 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 RerglB2RVE2 204 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tpst1O70281 370 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfy1P10925 782 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Clcn3P51791 818 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rusc1Q8BG26 893 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ptrh1Q8BW00 204 aa9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Thbs1-201ENSMUST00000039559 XntrpcF8VQM8 1264 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r39L7N2E5 861 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rrm2P11157 390 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fcer2P20693 331 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccng1P51945 294 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ptpn5P54830 541 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tbx1P70323 479 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gspt2Q149F3 632 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gpatch2lQ6PE65 482 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tcaf1Q8BNE1 924 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Depdc1aQ8CIG0 804 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 MutyhQ99P21 515 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ubiad1Q9DC60 336 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trpc2Q9R244 1172 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rps12P63323 132 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 GpamQ61586 827 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gga2Q6P5E6 603 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gpr141Q7TQP0 305 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Usp6nlQ80XC3 819 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Senp7Q8BUH8 1037 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Brat1Q8C3R1 822 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bbs2Q9CWF6 721 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdyl2Q9D5D8 503 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Inpp4aQ9EPW0 939 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ttc23lA6H6E9 458 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sptlc1O35704 473 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Apba3O88888 571 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp2d9P11714 504 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Snai1Q02085 264 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Muc1Q02496 630 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rcsd1Q3UZA1 412 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Atp13a3Q5XF89 1219 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PoliQ6R3M4 717 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcsk9Q80W65 694 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmtc3Q8BRH0 920 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zbtb8bQ8CII0 484 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klhl36Q8R124 613 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Smyd2Q8R5A0 433 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc13a3Q91Y63 600 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sept12Q9D451 317 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trim10Q9WUH5 489 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Guca2bO09051 106 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nr3c1P06537 783 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ptpn11P35235 597 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rtkn2Q14B46 604 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rbm44Q3V089 1013 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Btnl1Q7TST0 509 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Spata20Q80YT5 790 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Disc1Q811T9 852 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chchd6Q91VN4 273 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q922M7 232 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gins4Q99LZ3 223 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sike1Q9CPR7 207 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olig1Q9JKN5 260 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Grk1Q9WVL4 564 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Abca9Q8K449 1623 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm28168A0A087WNP1 180 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klhl18A0A0G2JGN5 579 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdr2lA2A6T1 465 aa9.58□□□□□ -0.88
Thbs1-201ENSMUST00000039559 2610008E11RikG3X964 669 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.4 ms