Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Gga2Q6P5E6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Gga2Q6P5E6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Gga2Q6P5E6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Gga2Q6P5E6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Gga2Q6P5E6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,28■■■□□ 2,92
Gga2Q6P5E6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Gga2Q6P5E6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Gga2Q6P5E6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Gga2Q6P5E6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gga2Q6P5E6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Gga2Q6P5E6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Gga2Q6P5E6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Gga2Q6P5E6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Gga2Q6P5E6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Gga2Q6P5E6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Gga2Q6P5E6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Gga2Q6P5E6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Gga2Q6P5E6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Gga2Q6P5E6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Gga2Q6P5E6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Gga2Q6P5E6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Gga2Q6P5E6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
Gga2Q6P5E6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Gga2Q6P5E6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Gga2Q6P5E6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Gga2Q6P5E6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Gga2Q6P5E6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gga2Q6P5E6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Gga2Q6P5E6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gga2Q6P5E6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Gga2Q6P5E6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Gga2Q6P5E6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Gga2Q6P5E6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Gga2Q6P5E6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Gga2Q6P5E6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Gga2Q6P5E6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Gga2Q6P5E6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Gga2Q6P5E6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Gga2Q6P5E6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Gga2Q6P5E6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Gga2Q6P5E6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Gga2Q6P5E6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gga2Q6P5E6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Gga2Q6P5E6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Gga2Q6P5E6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Gga2Q6P5E6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gga2Q6P5E6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gga2Q6P5E6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,25
Gga2Q6P5E6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Gga2Q6P5E6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gga2Q6P5E6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gga2Q6P5E6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gga2Q6P5E6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Gga2Q6P5E6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Gga2Q6P5E6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Gga2Q6P5E6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Gga2Q6P5E6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Gga2Q6P5E6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Gga2Q6P5E6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gga2Q6P5E6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Gga2Q6P5E6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Gga2Q6P5E6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Gga2Q6P5E6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Gga2Q6P5E6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Gga2Q6P5E6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Gga2Q6P5E6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Gga2Q6P5E6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Gga2Q6P5E6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Gga2Q6P5E6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gga2Q6P5E6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gga2Q6P5E6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gga2Q6P5E6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gga2Q6P5E6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gga2Q6P5E6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gga2Q6P5E6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gga2Q6P5E6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gga2Q6P5E6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gga2Q6P5E6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Gga2Q6P5E6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gga2Q6P5E6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gga2Q6P5E6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gga2Q6P5E6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gga2Q6P5E6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Gga2Q6P5E6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gga2Q6P5E6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Gga2Q6P5E6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Gga2Q6P5E6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gga2Q6P5E6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gga2Q6P5E6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Gga2Q6P5E6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gga2Q6P5E6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gga2Q6P5E6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gga2Q6P5E6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gga2Q6P5E6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Gga2Q6P5E6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Gga2Q6P5E6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Gga2Q6P5E6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
Gga2Q6P5E6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Gga2Q6P5E6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms