Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
Muc1Q02496 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Muc1Q02496 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Muc1Q02496 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Muc1Q02496 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Muc1Q02496 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Muc1Q02496 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Muc1Q02496 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Muc1Q02496 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Muc1Q02496 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Muc1Q02496 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Muc1Q02496 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Muc1Q02496 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Muc1Q02496 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Muc1Q02496 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Muc1Q02496 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Muc1Q02496 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Muc1Q02496 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Muc1Q02496 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Muc1Q02496 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Muc1Q02496 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Muc1Q02496 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Muc1Q02496 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Muc1Q02496 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Muc1Q02496 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Muc1Q02496 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Muc1Q02496 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Muc1Q02496 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Muc1Q02496 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Muc1Q02496 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Muc1Q02496 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Muc1Q02496 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Muc1Q02496 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Muc1Q02496 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Muc1Q02496 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Muc1Q02496 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Muc1Q02496 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Muc1Q02496 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Muc1Q02496 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Muc1Q02496 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Muc1Q02496 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Muc1Q02496 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Muc1Q02496 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Muc1Q02496 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Muc1Q02496 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Muc1Q02496 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Muc1Q02496 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Muc1Q02496 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Muc1Q02496 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Muc1Q02496 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Muc1Q02496 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Muc1Q02496 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Muc1Q02496 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Muc1Q02496 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Muc1Q02496 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Muc1Q02496 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Muc1Q02496 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Muc1Q02496 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Muc1Q02496 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Muc1Q02496 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Muc1Q02496 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Muc1Q02496 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Muc1Q02496 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Muc1Q02496 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Muc1Q02496 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Muc1Q02496 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Muc1Q02496 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Muc1Q02496 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Muc1Q02496 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Muc1Q02496 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Muc1Q02496 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Muc1Q02496 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Muc1Q02496 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Muc1Q02496 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Muc1Q02496 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Muc1Q02496 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Muc1Q02496 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Muc1Q02496 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Muc1Q02496 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Muc1Q02496 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Muc1Q02496 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Muc1Q02496 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Muc1Q02496 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Muc1Q02496 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Muc1Q02496 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Muc1Q02496 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Muc1Q02496 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Muc1Q02496 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Muc1Q02496 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Muc1Q02496 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Muc1Q02496 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Muc1Q02496 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Muc1Q02496 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Muc1Q02496 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Muc1Q02496 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Muc1Q02496 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Muc1Q02496 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Muc1Q02496 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Muc1Q02496 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Muc1Q02496 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms