RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611352.1

HOTAIR_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene HOTAIR_3, Length 97 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 NUCB2P80303 420 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CBX1P83916 185 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CDK17Q00537 523 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 E2F1Q01094 437 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 MYL7Q01449 175 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TSPY1Q01534 308 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TFAP4Q01664 338 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CYP27A1Q02318 531 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PLGLB1Q02325 96 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PTSQ03393 145 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 GAD2Q05329 585 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 DEUP1Q05D60 604 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 FAM160A1Q05DH4 1040 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ZNF33BQ06732 778 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PPARAQ07869 468 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 SLC20A2Q08357 652 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PDE4CQ08493 712 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 SLFN5Q08AF3 891 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 KCNA1Q09470 495 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 KLHL30Q0D2K2 578 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 FUT2Q10981 343 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 POU4F2Q12837 409 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CDH17Q12864 832 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 FAPQ12884 760 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 FOXL1Q12952 345 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PTP4A2Q12974 167 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 STRN3Q13033 797 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PAK1Q13153 545 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 SGCGQ13326 291 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ORC1Q13415 861 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 BIRC3Q13489 604 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ART3Q13508 389 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PEX6Q13608 980 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 MTMR1Q13613 665 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CDH18Q13634 790 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PMS2P11Q13670 270 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 MOGSQ13724 837 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 RUNX3Q13761 415 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 NCOA4Q13772 614 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CCNIQ14094 377 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TFDP1Q14186 410 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 GCKRQ14397 625 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 NEDD9Q14511 834 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 KRT33BQ14525 404 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 LPIN1Q14693 890 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 MVPQ14764 893 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 RTP5Q14D33 572 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 SEPT2Q15019 361 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ACAP2Q15057 778 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ACOX1Q15067 660 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PDIA6Q15084 440 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PLCL1Q15111 1095 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PCOLCEQ15113 449 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 E2F5Q15329 346 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TOMM20Q15388 145 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TLR1Q15399 786 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TPSAB1Q15661 275 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 E2F4Q16254 413 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 INAQ16352 499 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CRY1Q16526 586 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 RBBP7Q16576 425 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 NFIL3Q16649 462 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ARHGAP44Q17R89 818 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 BMT2Q1RMZ1 405 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 CLEC12BQ2HXU8 276 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ISXQ2M1V0 245 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 HYAL4Q2M3T9 481 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 SPRED3Q2MJR0 410 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 TCTN1Q2MV58 587 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 C2orf68Q2NKX9 166 aa0.22□□□□□ -2.37
HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 PROSER3Q2NL68 480 aa0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms