RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 HMBOX1Q6NT76 420 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 DENND1BQ6P3S1 775 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL24Q6TFL4 600 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 USP49Q70CQ1 688 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 TRABD2AQ86V40 505 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 RTKN2Q8IZC4 609 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC71Q8N4P6 559 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 STPG3Q8N7X2 389 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF366Q8N895 744 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CEP70Q8NHQ1 597 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 RABGGTAQ92696 567 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 RNF125Q96EQ8 232 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MED15Q96RN5 788 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 GORASP1Q9BQQ3 440 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 TAOK3Q9H2K8 898 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ZWILCHQ9H900 591 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SYNPO2LQ9H987 977 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 KRT84Q9NSB2 600 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 HCN3Q9P1Z3 774 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 LPAR3Q9UBY5 353 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ATP7AQ04656 1500 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 NEURL4Q96JN8 1562 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 A2ML1A8K2U0 1454 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 COL15A1P39059 1388 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 VWA3AA6NCI4 1184 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SP100P23497 879 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CCR9P51686 369 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CTSWP56202 376 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 LOXL3P58215 753 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PLIN5Q00G26 463 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CDC16Q13042 620 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CHAF1BQ13112 559 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CSHL1Q14406 222 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SNX30Q5VWJ9 437 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 RAP1GAP2Q684P5 730 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MTHFD1LQ6UB35 978 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CYP20A1Q6UW02 462 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 TMEFF1Q8IYR6 380 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MPP5Q8N3R9 675 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 FITM2Q8N6M3 262 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 NEK9Q8TD19 979 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA17Q96L03 361 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SLC46A2Q9BY10 475 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 OR10A2Q9H208 303 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 KCNH6Q9H252 994 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 VPS16Q9H269 839 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 VPS45Q9NRW7 570 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CNTN6Q9UQ52 1028 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ALKQ9UM73 1620 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 IQGAP1P46940 1657 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ZMYM3Q14202 1370 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM232C9JQI7 657 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 DNPH1O43598 174 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 DOK2O60496 412 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PEX10O60683 326 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 TBCAO75347 108 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 HMGCRP04035 888 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 C1QTNF9P0C862 333 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 AKR1B1P15121 316 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINA4P29622 427 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PPIFP30405 207 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ATICP31939 592 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 HSPA1LP34931 641 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 GRK5P34947 590 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 RAP1GAPP47736 663 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ALDH1A3P47895 512 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PRKAA2P54646 552 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ITGA1P56199 1179 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CLRN1P58418 232 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PTP4A2Q12974 167 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 RILPL1Q5EBL4 403 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SLC10A5Q5PT55 438 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 AFMIDQ63HM1 303 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 RINT1Q6NUQ1 792 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ADGRA1Q86SQ6 560 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 ZSCAN30Q86W11 494 aa2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms