RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	NELL1	Q92832	810 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	CD101	Q93033	1021 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876		K7ESF4	209 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876		M0QYV0	167 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	GABBR2	O75899	941 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	CXCL12	P48061	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	RGS7	P49802	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	CCR3	P51677	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SLC8A3	P57103	927 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	AMPD2	Q01433	879 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	NR1H3	Q13133	447 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ZBED1	O96006	694 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ADH5	P11766	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	KRT5	P13647	590 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	LCP1	P13796	627 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	DRD1	P21728	446 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PON1	P27169	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SLC6A11	P48066	632 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PSEN1	P49768	467 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	KDSR	Q06136	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	BECN2	A8MW95	431 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876		E7ENQ6	273 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	STC2	O76061	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	ADH1C	P00326	375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	HMBS	P08397	361 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	RALA	P11233	206 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SEC13	P55735	322 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	CNGA2	Q16280	664 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	HTR3D	Q70Z44	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPSA-208	ENST00000487876	P2RY11	Q96G91	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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