RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 CEP76Q8TAP6 659 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 XYLT2Q9H1B5 865 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SMYD3Q9H7B4 428 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 WASF3Q9UPY6 502 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 PDXKO00764 312 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 EXOC3O60645 756 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TULP3O75386 442 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 IRF1P10914 325 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 HOXB2P14652 356 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ITPKAP23677 461 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 AP3M2P53677 418 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 NFIL3Q16649 462 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZCWPW2Q504Y3 356 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZNF667Q5HYK9 610 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SNX30Q5VWJ9 437 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CLEC17AQ6ZS10 378 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 BBS7Q8IWZ6 715 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 HDDC3Q8N4P3 179 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 FRMD1Q8N878 549 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 NAT16Q8N8M0 369 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TERB1Q8NA31 727 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GOLGA5Q8TBA6 731 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 KCNK16Q96T55 309 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SCNM1Q9BWG6 230 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CCSER2Q9H7U1 834 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 KRT82Q9NSB4 513 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TMEM74BQ9NUR3 256 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 COMMD8Q9NX08 183 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GMIPQ9P107 970 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 PILRBQ9UKJ0 227 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZZEF1O43149 2961 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 AP1G2O75843 785 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 P4HA1P13674 534 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 NTSR1P30989 418 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CLDN10P78369 228 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GOLGA8FQ08AF8 430 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 NCOA4Q13772 614 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 DUOXA1Q1HG43 343 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GRAMD4Q6IC98 578 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SDE2Q6IQ49 451 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TMEM25Q86YD3 366 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZNF516Q92618 1163 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SLC6A14Q9UN76 642 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 MYOFQ9NZM1 2061 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 UPK3BL1B0FP48 263 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 UPK3BL2E5RIL1 263 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TLR5O60602 858 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZNF217O75362 1048 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SERPINF2P08697 491 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GABRG2P18507 467 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CDH8P55286 799 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 PNOCQ13519 176 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 CHPFQ8IZ52 775 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GATA6Q92908 595 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GSDMAQ96QA5 445 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 IL37Q9NZH6 218 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 GON4LQ3T8J9 2241 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ASPMQ8IZT6 3477 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa13.03□□□□□ -0.32
PRAME-204ENST00000403441 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms