RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 KYQ8NBH2 561 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 DNERQ8NFT8 737 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 WNK4Q96J92 1243 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TJP2Q9UDY2 1190 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 HACL1Q9UJ83 578 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SUPT3HO75486 399 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 STKLD1Q8NE28 680 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CERKQ8TCT0 537 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPAN16Q9UKR8 245 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 USP20Q9Y2K6 914 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ACOT9Q9Y305 439 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.9■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ETS1P14921 441 aa16.89■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 HMOX2P30519 316 aa16.89■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.89■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.89■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.89■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.89■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RRN3P2A6NIE6 340 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NDUFS3O75489 264 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 F9P00740 461 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP2C9P11712 490 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIK1P39086 918 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINB10P48595 397 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PEX5P50542 639 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 JAM2P57087 298 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NOMO3P69849 1222 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PARP6Q2NL67 630 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC153Q494R4 210 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CERS5Q8N5B7 392 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GEMP55040 296 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNK10P57789 538 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ZACNQ401N2 412 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX19Q92543 992 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TLCD1Q96CP7 247 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 VWA5AO00534 786 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 C2CD2LO14523 706 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 BNIP3LO60238 219 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TGFB3P10600 412 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NFKBIAP25963 317 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NR2C2P49116 596 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PTK2BQ14289 1009 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PWWP2AQ96N64 755 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 WDCPQ9H6R7 721 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.89■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ALOX15BO15296 676 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ASB7Q9H672 318 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PMPCBO75439 489 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CALCAP01258 141 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 HMGCRP04035 888 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PYGLP06737 847 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNA4P22459 653 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 AMHR2Q16671 573 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 UBXN6Q9BZV1 441 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 IL1RL2Q9HB29 575 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CHADO15335 359 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM13O60858 407 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL22P35268 128 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GLRBP48167 497 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NDST1P52848 882 aa16.88■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR162Q16538 588 aa16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms