RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSSK4Q6SA08 328 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD101Q93033 1021 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDST4Q9H3R1 872 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS13AQ96RL7 3174 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBED1O96006 694 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 RALAP11233 206 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 TDGF1P13385 188 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPRD1P41143 372 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCR3P51677 355 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFAP3P55082 362 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SATB1Q01826 763 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 VWA3BQ502W6 1294 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTUB2Q96DC9 234 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 R4GN57 208 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 BECN2A8MW95 431 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABBR2O75899 941 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADH1CP00326 375 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRD1P21728 446 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS7P49802 495 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMF1Q6P1K2 205 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTR3DQ70Z44 454 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHC3Q92529 594 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 NELL1Q92832 810 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM81BQ96LP2 452 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACP6Q9NPH0 428 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADH5P11766 374 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX1AQ16623 288 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf40Q86WS4 652 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIB1Q86YT6 1006 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCML4Q8N228 414 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOC4Q96A65 974 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANO10Q9NW15 660 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP34Q70CQ2 3546 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 E7ENQ6 273 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF40O75150 1001 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCP1P13796 627 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXCL12P48061 93 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAOAP59103 153 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFEMP1Q12805 493 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZNB5 142 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR23AA6NEV1 266 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3R2O00459 728 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFRA3O60609 400 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 STC2O76061 302 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNA15P30679 374 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPD2P43304 727 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNMA1Q12791 1236 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEA1Q16626 185 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms