RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 PAX3P23760 479 aa22.1■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 SCNN1AP37088 669 aa22.1■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.1■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 CEP57Q86XR8 500 aa22.1■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.1■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 USP17L7P0C7H9 530 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 PTPN9P43378 593 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 GJA8P48165 433 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 SLC11A1P49279 550 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 LBX1P52954 281 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 TSPY1Q01534 308 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 MMRN1Q13201 1228 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 CUL1Q13616 776 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 EMBQ6PCB8 327 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 TBCBQ99426 244 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 HSF2BPO75031 334 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 ECEL1O95672 775 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 CDH6P55285 790 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 DCAF6Q58WW2 860 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 ARMC5Q96C12 935 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC114Q96M63 670 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.09■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 E7ENQ6 273 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 PTPN7P35236 360 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 MATKP42679 507 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 CCNG2Q16589 344 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 CA9Q16790 459 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 RAB41Q5JT25 222 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 MARCH5Q9NX47 278 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.08■■□□□ 1.13
RFXAP-201ENST00000255476 CST8O60676 142 aa22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 ALDH2P05091 517 aa22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 ITGB8P26012 769 aa22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 KRT17Q04695 432 aa22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 PPP1R7Q15435 360 aa22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 ARCQ7LC44 396 aa22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 CYP2F1P24903 491 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 DAOAP59103 153 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 TAZQ16635 292 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 CAVIN3Q969G5 261 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 COX16Q9P0S2 106 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 TRAPPC3O43617 180 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 OAZ2O95190 189 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 FYNP06241 537 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 CLTBP09497 229 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 SULT1E1P49888 294 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.07■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 LIASO43766 372 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 DAB1O75553 588 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 ARSEP51690 589 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 DPYSL3Q14195 570 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 RFX6Q8HWS3 928 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 ATL2Q8NHH9 583 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 BOLA3Q53S33 107 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC185Q8N715 623 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 SLCO2A1Q92959 643 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.06■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 HOXA2O43364 376 aa22.05■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 ENDOD1O94919 500 aa22.05■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 ZBED1O96006 694 aa22.05■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 GALTP07902 379 aa22.05■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 DESP17661 470 aa22.05■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 VPS41P49754 854 aa22.05■■□□□ 1.12
RFXAP-201ENST00000255476 PLTPP55058 493 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms