RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 ATP6V1AP38606 617 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 LRCH3Q96II8 777 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 RNF40O75150 1001 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 COG6Q9Y2V7 657 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-208ENST00000578600 AP1G2O75843 785 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 MTMR2Q13614 643 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 NECTIN2Q92692 538 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 ARID3AQ99856 593 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 MORN1Q5T089 497 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
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PTPRM-208ENST00000578600 APBB1O00213 710 aa9.81□□□□□ -0.84
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PTPRM-208ENST00000578600 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 ARID3CA6NKF2 412 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRM-208ENST00000578600 CFAP99D6REC4 459 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-208ENST00000578600 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-208ENST00000578600 C6orf229H3BNL8 230 aa9.78□□□□□ -0.84
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PTPRM-208ENST00000578600 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
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PTPRM-208ENST00000578600 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.7□□□□□ -0.86
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PTPRM-208ENST00000578600 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-208ENST00000578600 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-208ENST00000578600 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
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PTPRM-208ENST00000578600 POTEGQ6S5H5 508 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
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