RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.16■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.14■□□□□ 0.17
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.14■□□□□ 0.17
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFT140Q96RY7 1462 aa16.14■□□□□ 0.17
USP3-AS1-204ENST00000559861 FUT2Q10981 343 aa16.13■□□□□ 0.17
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP6V1AP38606 617 aa16.1■□□□□ 0.17
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.1■□□□□ 0.17
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHD1O14646 1710 aa16.1■□□□□ 0.17
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXA2O43364 376 aa16.09■□□□□ 0.17
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOPBP1Q92547 1522 aa16.09■□□□□ 0.17
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.08■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYSM1Q5VVJ2 828 aa16.08■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.08■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 MORN1Q5T089 497 aa16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 GOPCQ9HD26 462 aa16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 GJA5P36382 358 aa16.03■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFV2P19404 249 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 HLA-CQ95604 372 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPTLC1O15269 473 aa16.01■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARAP1Q96P48 1450 aa16.01■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC88BA6NC98 1476 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIC3Q7Z5B4 369 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTRQ99707 1265 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 COPS2P61201 443 aa15.99■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.99■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa15.99■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 NR1I2O75469 434 aa15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 FDX1P10109 184 aa15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCC8Q09428 1581 aa15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 GUCA2AQ02747 115 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCUBE3Q8IX30 993 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 LIMD1Q9UGP4 676 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 TUSC1Q2TAM9 212 aa15.96■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL21Q9HBE4 155 aa15.96■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.96■□□□□ 0.15
USP3-AS1-204ENST00000559861 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.93■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZPR1O75312 459 aa15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR97A6NE52 1622 aa15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q3C1V9 767 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF516Q92618 1163 aa15.91■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 THAP11Q96EK4 314 aa15.9■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 BRICD5Q6PL45 260 aa15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNC4Q03721 635 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.87■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.86■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 LILRB3O75022 631 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 C6orf229H3BNL8 230 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 HRCP23327 699 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 QPCTQ16769 361 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-204ENST00000559861 TLL1O43897 1013 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTMR2Q13614 643 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPSB2Q99619 263 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADH1BP00325 375 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 RETREG3Q86VR2 466 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.8■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.8■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NKX2-3Q8TAU0 364 aa15.8■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.79■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYNJ1O43426 1573 aa15.79■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFFO2Q5TF58 517 aa15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MSS51Q4VC12 460 aa15.77■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
USP3-AS1-204ENST00000559861 PBRM1Q86U86 1689 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms