RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 MTHFSP49914 203 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.2■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTMSP20962 102 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.19■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM27P14373 513 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 PKP1Q13835 747 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMC5Q8IY18 1101 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGEF11O15085 1522 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 AAMPQ13685 434 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 NLRP1Q9C000 1473 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.11■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 GDPD2Q9HCC8 539 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 CUL7Q14999 1698 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 DYNC1I1O14576 645 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF16BQ96L93 1317 aa18.1■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 NUCB2P80303 420 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 SNX21Q969T3 373 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CCNDBP1-201ENST00000300213 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.07■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 SAMD9Q5K651 1589 aa18.07■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.06■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.06■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 WDR63Q8IWG1 891 aa18.05■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 ST18O60284 1047 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 VGLL3A8MV65 326 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 NGEFQ8N5V2 710 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP25Q9UHP3 1055 aa18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 INSRP06213 1382 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDC45O75419 566 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPC24Q8NBT2 197 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 NUCB1Q02818 461 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERCC6Q03468 1493 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 A2MP01023 1474 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 FGD1P98174 961 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDE4CQ08493 712 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 CASC1Q6TDU7 716 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPT2Q8TD30 523 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEK4P51957 841 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSPY26PQ9H489 355 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms