RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000073128.6

Sh3bp5l-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp5l, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 MaddQ80U28 1577 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Gli2Q0VGT2 1544 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 EspnQ9ET47 871 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 4933416C03RikQ3V063 378 aa16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ralbp1Q62172 648 aa16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Golga2Q921M4 999 aa16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Uspl1Q3ULM6 1089 aa16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Adgrl3Q80TS3 1537 aa16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cfap65Q3V0B4 1847 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Skint5A7XUY5 1461 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 AglF8VPN4 1532 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 PalldQ9ET54 1408 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Iqcf3Q9D498 203 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 AdgbG3UZ78 1657 aa16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 InsrP15208 1372 aa16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Neurod2Q62414 383 aa16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 ChgaP26339 463 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 B4galnt3Q6L8S8 986 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Nkx1-2P42580 305 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Hfm1D3Z4R1 1434 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Iqsec2Q5DU25 1478 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Lrrc7Q80TE7 1490 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Mroh1E0CZ22 1640 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 DaxxO35613 739 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Chmp5Q9D7S9 219 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Apbb1Q9QXJ1 710 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cul9Q80TT8 1865 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 AU022751B1B0V2 589 aa16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Adgrl1Q80TR1 1466 aa16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Gm156Q58A37 223 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Adamts7Q68SA9 1657 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Znf521Q6KAS7 1311 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 RereQ80TZ9 1558 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ptch1Q61115 1434 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 NudcO35685 332 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Slc52a2Q9D8F3 450 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Kiaa0556Q8C753 1610 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Stag3O70576 1240 aa16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Knl1Q66JQ7 1612 aa16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 AampJ3QN89 436 aa16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cnga1P29974 684 aa16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Dbr1Q923B1 550 aa16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Dip2cE9PWR4 1557 aa16.33■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 GsdmaQ9EST1 446 aa16.33■□□□□ 0.21
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ttc37F8VPK0 1563 aa16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 P2rx7Q9Z1M0 595 aa16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Hecw2Q6I6G8 1578 aa16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 CenpjQ569L8 1344 aa16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Nrxn1Q9CS84 1514 aa16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Gas2l2Q5SSG4 860 aa16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 IqubQ8CDK3 788 aa16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 CanxP35564 591 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Tspyl2Q7TQI8 677 aa16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Fam135bQ9DAI6 1403 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Trim58Q5NCC9 485 aa16.3■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ppm1gQ61074 542 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Tmc1Q8R4P5 757 aa16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Znf692Q3U381 531 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Dnai1Q8C0M8 701 aa16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Pank1Q8K4K6 548 aa16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Mre11Q61216 706 aa16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Atxn3Q9CVD2 355 aa16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ipo4Q8VI75 1082 aa16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ipo8Q7TMY7 1010 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Qser1A2BIE1 1698 aa16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ak7Q9D2H2 614 aa16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Rlbp1Q9Z275 317 aa16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Arhgef28P97433 1693 aa16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Tsen2Q6P7W5 460 aa16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ccdc183A2AJB1 534 aa16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Trim30dE9PWL0 497 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Taok2Q6ZQ29 1240 aa16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Apaf1O88879 1249 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Znf541Q0GGX2 1363 aa16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Ksr2Q3UVC0 959 aa16.17■□□□□ 0.18
Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 Usp32F8VPZ3 1604 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.1 ms