RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gas2l2Q5SSG4 860 aa29.25■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trpm1Q2TV84 1622 aa29.25■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Uggt1Q6P5E4 1551 aa29.25■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Znf521Q6KAS7 1311 aa29.24■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cnga1P29974 684 aa29.24■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ipo8Q7TMY7 1010 aa29.23■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Efcab6Q6P1E8 1516 aa29.22■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pank1Q8K4K6 548 aa29.21■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa29.21■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tmc1Q8R4P5 757 aa29.21■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Prex1Q69ZK0 1650 aa29.21■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trim58Q5NCC9 485 aa29.2■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trim30dE9PWL0 497 aa29.2■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ak7Q9D2H2 614 aa29.2■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa29.2■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa29.19■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AampJ3QN89 436 aa29.18■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 GsdmaQ9EST1 446 aa29.18■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa29.18■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 4933416C03RikQ3V063 378 aa29.18■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Irx3P81067 507 aa29.17■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 P2rx7Q9Z1M0 595 aa29.15■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Iqsec2Q5DU25 1478 aa29.15■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Depdc5P61460 1591 aa29.14■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Stag3O70576 1240 aa29.14■■■□□ 2.26
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc183A2AJB1 534 aa29.13■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arid3cA6PWV5 409 aa29.12■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atxn3Q9CVD2 355 aa29.12■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 InsrP15208 1372 aa29.12■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa29.12■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa29.11■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fam135bQ9DAI6 1403 aa29.1■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa29.1■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Skint5A7XUY5 1461 aa29.1■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hfm1D3Z4R1 1434 aa29.1■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tecpr2Q3UH45 1423 aa29.1■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PalldQ9ET54 1408 aa29.1■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 MaddQ80U28 1577 aa29.09■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rlbp1Q9Z275 317 aa29.09■■■□□ 2.25
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Adgrl3Q80TS3 1537 aa29.07■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AU022751B1B0V2 589 aa29.07■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PtprtQ99M80 1454 aa29.05■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 OvosQ3UU35 1456 aa29.04■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa29.04■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 IqubQ8CDK3 788 aa29.04■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lrrc7Q80TE7 1490 aa29.03■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Akap12Q9WTQ5 1684 aa29.02■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CenpjQ569L8 1344 aa29.02■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gli2Q0VGT2 1544 aa29.01■■■□□ 2.24
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pdlim2Q8R1G6 349 aa29.01■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Adgrl1Q80TR1 1466 aa29.01■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Slc52a2Q9D8F3 450 aa29■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa29■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ksr2Q3UVC0 959 aa28.99■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Polr3glQ8R0C0 218 aa28.99■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Apaf1O88879 1249 aa28.98■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ino80Q6ZPV2 1559 aa28.97■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa28.97■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atp10aO54827 1508 aa28.97■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tsen2Q6P7W5 460 aa28.96■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ift172Q6VH22 1749 aa28.95■■■□□ 2.23
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Armcx1Q9CX83 456 aa28.92■■■□□ 2.22
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ttc37F8VPK0 1563 aa28.9■■■□□ 2.22
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atl3Q91YH5 541 aa28.9■■■□□ 2.22
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trim26Q99PN3 545 aa28.9■■■□□ 2.22
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28.9■■■□□ 2.22
Ccsap-201ENSMUST00000034452 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nrxn1Q9CS84 1514 aa28.89■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa28.88■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ptch1Q61115 1434 aa28.88■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mroh1E0CZ22 1640 aa28.88■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Htatsf1Q8BGC0 757 aa28.86■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dusp27Q148W8 1138 aa28.86■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kiaa0556Q8C753 1610 aa28.85■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sptbn5F6UCX4 1208 aa28.84■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AglF8VPN4 1532 aa28.83■■■□□ 2.21
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa28.82■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm6268A2A3U9 297 aa28.82■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rabep1O35551 862 aa28.8■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ciz1Q8VEH2 845 aa28.8■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa28.78■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cfap65Q3V0B4 1847 aa28.77■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hs1bp3Q3TC93 395 aa28.77■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Stk26Q99JT2 416 aa28.77■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa28.77■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Knl1Q66JQ7 1612 aa28.76■■■□□ 2.2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 ArxO35085 564 aa28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.7 ms