RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rassf8Q8CJ96 419 aa15.06■□□□□ 0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf608Q56A10 1511 aa15.05■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chmp3Q9CQ10 224 aa15.05■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc183A2AJB1 534 aa15.04■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa15.04■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gnai1B2RSH2 354 aa15.04■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10471E9Q1C7 252 aa15.04■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gnai3Q9DC51 354 aa15.04■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sh3bp5Q9Z131 463 aa15.03■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Slc52a2Q9D8F3 450 aa15.03■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Klhdc4Q921I2 584 aa15.03■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fkbp4P30416 458 aa15.03■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q4VA45 678 aa15.03■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trim44Q9QXA7 346 aa15.02□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Abca5Q8K448 1642 aa15.01□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 AlkP97793 1621 aa15□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zfp777B9EKF4 885 aa15□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa15□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nek4Q9Z1J2 792 aa15□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sv2bQ8BG39 683 aa15□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dennd6aQ8BH65 605 aa15□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q9D2X8 372 aa15□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ptch1Q61115 1434 aa14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q3UJC8 639 aa14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Adamts12Q811B3 1600 aa14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa14.99□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zranb3Q6NZP1 1069 aa14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cog6Q8R3I3 657 aa14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Map3k13Q1HKZ5 959 aa14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10563F6WIE4 79 aa14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 MecomP14404 1042 aa14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 GnpatP98192 678 aa14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Peg3Q3URU2 1571 aa14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccne1Q61457 408 aa14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 AppP12023 770 aa14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pcmtd1P59913 357 aa14.97□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Arhgef11Q68FM7 1552 aa14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Camsap2Q8C1B1 1461 aa14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 NinlQ6ZQ12 1394 aa14.96□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nol12Q8BG17 217 aa14.96□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Bcl11bQ99PV8 884 aa14.96□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Phactr2B1AVP0 632 aa14.95□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa14.95□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 TnikP83510 1323 aa14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Erbb3Q61526 1339 aa14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lmod3E9QA62 571 aa14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem132eQ6IEE6 982 aa14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Egfem1Q8C088 590 aa14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chmp7Q8R1T1 451 aa14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Naip6Q9JIB6 1403 aa14.94□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CgnP59242 1191 aa14.93□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Uspl1Q3ULM6 1089 aa14.93□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Stk3Q9JI10 497 aa14.93□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Hmox1P14901 289 aa14.93□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SlkO54988 1233 aa14.92□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 MccE9PWI3 1003 aa14.92□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Neurod6P48986 337 aa14.92□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PtprgQ05909 1442 aa14.92□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Atf3Q60765 181 aa14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 BcanQ61361 883 aa14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rusc2Q80U22 1514 aa14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SkilQ60665 675 aa14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 AatkQ80YE4 1365 aa14.91□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam50bQ9WTJ8 334 aa14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Abcc2Q8VI47 1543 aa14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SphkapQ6NSW3 1687 aa14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 HdgfP51859 237 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Exoc6bA6H5Z3 810 aa14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kif18aQ91WD7 886 aa14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa14.9□□□□□ -0.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Acsbg1Q99PU5 721 aa14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 HypkQ9CR41 129 aa14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Abca16E9PWJ7 1678 aa14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q3UPC7 1272 aa14.89□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Abcc6Q9R1S7 1498 aa14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem94Q7TSH8 1360 aa14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Erich6bQ9D4S6 220 aa14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cwc27Q3TKY6 469 aa14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Iffo2Q8R2V2 512 aa14.88□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm21698A0A087WQP8 267 aa14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm21671G3UY31 267 aa14.87□□□□□ -0.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Irx3P81067 507 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28 ms