Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC63,7■■■■■ 7,79
Abca16E9PWJ7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59,4■■■■■ 7,1
Abca16E9PWJ7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58■■■■■ 6,87
Abca16E9PWJ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC55,76■■■■■ 6,52
Abca16E9PWJ7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC55,1■■■■■ 6,41
Abca16E9PWJ7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC54,05■■■■■ 6,24
Abca16E9PWJ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53,87■■■■■ 6,21
Abca16E9PWJ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53,51■■■■■ 6,16
Abca16E9PWJ7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53,5■■■■■ 6,16
Abca16E9PWJ7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53,38■■■■■ 6,14
Abca16E9PWJ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC52,99■■■■■ 6,07
Abca16E9PWJ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52,04■■■■■ 5,92
Abca16E9PWJ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51,56■■■■■ 5,84
Abca16E9PWJ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,43■■■■■ 5,82
Abca16E9PWJ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51,42■■■■■ 5,82
Abca16E9PWJ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,21■■■■■ 5,79
Abca16E9PWJ7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,02■■■■■ 5,76
Abca16E9PWJ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,99■■■■■ 5,75
Abca16E9PWJ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,75■■■■■ 5,71
Abca16E9PWJ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50,62■■■■■ 5,69
Abca16E9PWJ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,54■■■■■ 5,68
Abca16E9PWJ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50,47■■■■■ 5,67
Abca16E9PWJ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50,41■■■■■ 5,66
Abca16E9PWJ7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,38■■■■■ 5,66
Abca16E9PWJ7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,86■■■■■ 5,57
Abca16E9PWJ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49,52■■■■■ 5,52
Abca16E9PWJ7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,46■■■■■ 5,51
Abca16E9PWJ7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49,35■■■■■ 5,49
Abca16E9PWJ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49,35■■■■■ 5,49
Abca16E9PWJ7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,29■■■■■ 5,48
Abca16E9PWJ7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,15■■■■■ 5,46
Abca16E9PWJ7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49,05■■■■■ 5,44
Abca16E9PWJ7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5,43
Abca16E9PWJ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,96■■■■■ 5,43
Abca16E9PWJ7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,95■■■■■ 5,43
Abca16E9PWJ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48,79■■■■■ 5,4
Abca16E9PWJ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC48,69■■■■■ 5,39
Abca16E9PWJ7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48,68■■■■■ 5,38
Abca16E9PWJ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48,42■■■■■ 5,34
Abca16E9PWJ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,25■■■■■ 5,31
Abca16E9PWJ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48,1■■■■■ 5,29
Abca16E9PWJ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC48,1■■■■■ 5,29
Abca16E9PWJ7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,98■■■■■ 5,27
Abca16E9PWJ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47,93■■■■■ 5,26
Abca16E9PWJ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC47,86■■■■■ 5,25
Abca16E9PWJ7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,84■■■■■ 5,25
Abca16E9PWJ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,79■■■■■ 5,24
Abca16E9PWJ7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,64■■■■■ 5,22
Abca16E9PWJ7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47,62■■■■■ 5,21
Abca16E9PWJ7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,61■■■■■ 5,21
Abca16E9PWJ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47,53■■■■■ 5,2
Abca16E9PWJ7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47,47■■■■■ 5,19
Abca16E9PWJ7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,45■■■■■ 5,19
Abca16E9PWJ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47,45■■■■■ 5,19
Abca16E9PWJ7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47,42■■■■■ 5,18
Abca16E9PWJ7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47,36■■■■■ 5,17
Abca16E9PWJ7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47,34■■■■■ 5,17
Abca16E9PWJ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47,27■■■■■ 5,16
Abca16E9PWJ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47,25■■■■■ 5,15
Abca16E9PWJ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,17■■■■■ 5,14
Abca16E9PWJ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47,13■■■■■ 5,13
Abca16E9PWJ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,02■■■■■ 5,12
Abca16E9PWJ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46,9■■■■■ 5,1
Abca16E9PWJ7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46,79■■■■■ 5,08
Abca16E9PWJ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,76■■■■■ 5,08
Abca16E9PWJ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46,71■■■■■ 5,07
Abca16E9PWJ7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46,64■■■■■ 5,06
Abca16E9PWJ7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46,54■■■■■ 5,04
Abca16E9PWJ7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,52■■■■■ 5,04
Abca16E9PWJ7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46,46■■■■■ 5,03
Abca16E9PWJ7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,43■■■■■ 5,02
Abca16E9PWJ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,39■■■■■ 5,02
Abca16E9PWJ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC46,32■■■■■ 5,01
Abca16E9PWJ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46,28■■■■■ 5
Abca16E9PWJ7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,27■■■■■ 5
Abca16E9PWJ7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46,27■■■■■ 5
Abca16E9PWJ7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46,2■■■■■ 4,99
Abca16E9PWJ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,15■■■■■ 4,98
Abca16E9PWJ7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46,14■■■■■ 4,98
Abca16E9PWJ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,1■■■■■ 4,97
Abca16E9PWJ7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4,95
Abca16E9PWJ7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46■■■■■ 4,95
Abca16E9PWJ7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45,86■■■■■ 4,93
Abca16E9PWJ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,85■■■■■ 4,93
Abca16E9PWJ7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45,81■■■■■ 4,92
Abca16E9PWJ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC45,77■■■■■ 4,92
Abca16E9PWJ7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45,65■■■■■ 4,9
Abca16E9PWJ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45,62■■■■■ 4,89
Abca16E9PWJ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45,57■■■■■ 4,88
Abca16E9PWJ7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45,55■■■■■ 4,88
Abca16E9PWJ7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,53■■■■■ 4,88
Abca16E9PWJ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,51■■■■■ 4,88
Abca16E9PWJ7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45,51■■■■■ 4,88
Abca16E9PWJ7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45,49■■■■■ 4,87
Abca16E9PWJ7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,49■■■■■ 4,87
Abca16E9PWJ7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,46■■■■■ 4,87
Abca16E9PWJ7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45,39■■■■■ 4,86
Abca16E9PWJ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,36■■■■■ 4,85
Abca16E9PWJ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,33■■■■■ 4,85
Abca16E9PWJ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,29■■■■■ 4,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,1 ms