RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PODXL	O00592	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PPM1D	O15297	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	FFAR2	O15552	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	TRIAP1	O43715	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	NDST3	O95803	873 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ERBB2	P04626	1255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	NHLH1	Q02575	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ELF2	Q15723	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	GGT6	Q6P531	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	MUL1	Q969V5	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	TIMP4	Q99727	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	RASAL1	O95294	804 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	IDE	P14735	1019 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	JUP	P14923	745 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	DRD4	P21917	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CHKA	P35790	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	HAL	P42357	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CLCN2	P51788	898 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	DGKE	P52429	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	COPA	P53621	1224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ITGA8	P53708	1063 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PRKAG1	P54619	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	NPY5R	Q15761	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876		A0A087WZ62	844 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	RGS10	O43665	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CREB3	O43889	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PIAS2	O75928	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	NR2F6	P10588	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	KCNA3	P22001	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	GABRB3	P28472	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	BLMH	Q13867	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	E2F2	Q14209	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	TBCC	Q15814	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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