RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541284.5

CNOT4-212, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CNOT4, Length 3,563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-212ENST00000541284 MAGEA6P43360 314 aa9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 BBS9Q3SYG4 887 aa9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 RINLQ6ZS11 566 aa9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PQLC3Q8N755 202 aa9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.829e-7■■■■□ 20.1
CNOT4-212ENST00000541284 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.96□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 MAP3K13O43283 966 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 LINGO3P0C6S8 592 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 RBP3P10745 1247 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PHBP35232 272 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CCNFP41002 786 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 MAGEA3P43357 314 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 NAA25Q14CX7 972 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 TEX44Q53QW1 395 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 TREML2Q5T2D2 321 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 IER5Q5VY09 327 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 FAM136AQ96C01 138 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CDT1Q9H211 546 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 USP18Q9UMW8 372 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PPME1Q9Y570 386 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CEP83Q9Y592 693 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PTPRDP23468 1912 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 TRIP11Q15643 1979 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 UNCXA6NJT0 531 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CAPN14A8MX76 684 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 GPR25O00155 361 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 KLF11O14901 512 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 GSC2O15499 205 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CXCL8P10145 99 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PCK1P35558 622 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 TUBP50607 506 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PTK7Q13308 1070 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 AMHR2Q16671 573 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 LY6KQ17RY6 165 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PLD5Q8N7P1 536 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 RNF149Q8NC42 400 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CHST13Q8NET6 341 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 GPR20Q99678 358 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 HEY2Q9UBP5 337 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 EVPLQ92817 2033 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 SMAPO00193 183 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 RFPL1O75677 317 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 GSRP00390 522 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 BGNP21810 368 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 SERPINB3P29508 390 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CDK16Q00536 496 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 VGLL4Q14135 290 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 FBXO27Q8NI29 283 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 SPATA18Q8TC71 538 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 NME7Q9Y5B8 376 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 BRCA2P51587 3418 aa9.95□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 ACKR2O00590 384 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 UGT1A9O60656 530 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PYGBP11216 843 aa9.94□□□□□ -0.82
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CNOT4-212ENST00000541284 ALDH3A1P30838 453 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 METTL7BQ6UX53 244 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 RFX6Q8HWS3 928 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 HSPH1Q92598 858 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 CYTH2Q99418 400 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.94□□□□□ -0.82
CNOT4-212ENST00000541284 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.94□□□□□ -0.82
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