RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 F8W735 103 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 B4GALT3O60512 393 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF623O75123 536 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 LTFP02788 710 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 NFICP08651 508 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 LAMP2P13473 410 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLS3P13797 630 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPC5P78333 572 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 OCRLQ01968 901 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 MORC3Q14149 939 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 GRM3Q14832 879 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 XKR3Q5GH77 459 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 IL31Q6EBC2 164 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 BICD2Q8TD16 824 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 GJA10Q969M2 543 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 RIT2Q99578 217 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 APOL6Q9BWW8 343 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 HDAC8Q9BY41 377 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 USP18Q9UMW8 372 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC66A2RUB6 948 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM170BA6NMN3 283 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADAMTS3O15072 1205 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 MSH4O15457 936 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 ERLIN2O94905 339 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCND1P24385 295 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 CIITAP33076 1130 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 GTF2H3Q13889 308 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 NECTIN1Q15223 517 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 C11orf74Q86VG3 221 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 CRYGNQ8WXF5 182 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 AIFM3Q96NN9 605 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZMYND12Q9H0C1 365 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 CACNA1AO00555 2505 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 ESYT2A0FGR8 921 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 GLULP15104 373 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD72P21854 359 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 USP11P51784 963 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 NEK3P51956 506 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 NLRP5P59047 1200 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 STARD6P59095 220 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCNAB2Q13303 367 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDK5R2Q13319 367 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 HTR4Q13639 388 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRC32Q14392 662 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 BROXQ5VW32 411 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 MBLAC2Q68D91 279 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 PARM1Q6UWI2 310 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 Q6ZS46 218 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 CMIPQ8IY22 773 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNNM3Q8NE01 707 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 RDM1Q8NG50 284 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM143Q96AN5 459 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 LENG9Q96B70 501 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 CEP170P1Q96L14 293 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 B3GALT6Q96L58 329 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 GAD1Q99259 594 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDIP1Q9H305 208 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 IPPKQ9H8X2 491 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms