RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 KRT35Q92764 455 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CYP4F12Q9HCS2 524 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SPATA2Q9UM82 520 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 KLHL20Q9Y2M5 609 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 AKAP3O75969 853 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 MYO1DO94832 1006 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CSPG5O95196 566 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SERPINE1P05121 402 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 NUDT17P0C025 328 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FLT3P36888 993 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RAD23AP54725 363 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FAAP100Q0VG06 881 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TROAPQ12815 778 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ARPINQ7Z6K5 226 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TTC7BQ86TV6 843 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SHCBP1Q8NEM2 672 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 NAT14Q8WUY8 206 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ITFG2Q969R8 447 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ZMPSTE24O75844 475 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GZMAP12544 262 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TGM2P21980 687 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 Q3C1V9 767 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GPR107Q5VW38 600 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CCDC33Q8N5R6 958 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ABCB10Q9NRK6 738 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SHOC2Q9UQ13 582 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 INPP4BO15327 924 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CYTH3O43739 400 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CASP5P51878 434 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 BNIP1Q12981 228 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 LPCAT4Q643R3 524 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 C17orf50Q8WW18 174 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 EPAS1Q99814 870 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 AGXT2Q9BYV1 514 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DNAJC18Q9H819 358 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CHST7Q9NS84 486 aa10.12□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RAD17O75943 681 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PROSCO94903 275 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 UQCRBP14927 111 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RPA1P27694 616 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PTGER2P43116 358 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DSTYKQ6XUX3 929 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SLC47A2Q86VL8 602 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ULK2Q8IYT8 1036 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 EXD1Q8NHP7 514 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SEPT1Q8WYJ6 367 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 HPS4Q9NQG7 708 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 NCAPD2Q15021 1401 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 F5H6K3 240 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SFNP31947 248 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SULT1E1P49888 294 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 AP3M2P53677 418 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 KLRC3Q07444 240 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TRAF3Q13114 568 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 TNFAIP1Q13829 316 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PDK4Q16654 411 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FAM83EQ2M2I3 478 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CLEC10AQ8IUN9 316 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 CCNJLQ8IV13 435 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SNPHO15079 494 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 UBDO15205 165 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 PWP1Q13610 501 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SGO1Q5FBB7 561 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 GLRA4Q5JXX5 417 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 ACTL9Q8TC94 416 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 BORCS5Q969J3 196 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 SP110Q9HB58 689 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 FAM49BQ9NUQ9 324 aa10.11□□□□□ -0.79
HERC3-202ENST00000402738 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms