RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Apol7eQ3UZ24 369 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptpn18Q61152 453 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Retreg2Q6NS82 541 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc51bQ80WK2 128 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifi205aQ8CGE8 404 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdhb19Q91Y01 801 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bbox1Q924Y0 387 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rasgef1cQ9D300 466 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ism1A2ATD1 454 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scgb2b7D3YYY1 112 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rgs22G3UYX5 1258 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fez2Q6TYB5 348 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb9Q8CDC7 459 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr348Q8VGK3 313 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trmt11Q9CWH5 460 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rmdn1Q9DCV4 305 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kank3Q9Z1P7 791 aa12.3□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rabgap1lA6H6A9 815 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap42B2RQE8 841 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp850J3QPC5 689 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dynlt1P51807 113 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 IhhP97812 411 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpf39Q8K2Z2 665 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ugt2b1Q8R084 529 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Etv3Q8R4Z4 513 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Angel1Q8VCU0 667 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 DeraQ91YP3 318 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sntg2Q925E0 539 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tsnaxip1Q99P25 704 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dlgap1Q9D415 992 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rabl3Q9D4V7 236 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cep350E9Q309 3095 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 FancfE9Q5Z5 343 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11239E9Q5Z9 360 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11237F2Z3W5 360 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11238F2Z478 360 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cacna2d1O08532 1103 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cldn5O54942 218 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ca8P28651 291 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sh3bp1P55194 680 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pde1bQ01065 535 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm428Q3UTE2 360 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syne3Q4FZC9 975 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps41Q5KU39 853 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf5Q8C092 801 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif2b5Q8CHW4 717 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 OafQ8QZR4 282 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Caskin2Q8VHK1 1201 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 MutyhQ99P21 515 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 PmpcbQ9CXT8 489 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mapk13Q9Z1B7 366 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Osbpl9A2A8Z1 736 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pramef17A2ASJ1 475 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930402K13RikB1AW18 415 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Soat2O88908 525 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxb8P09632 243 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc34Q3UI66 367 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 RbfaQ6P3B9 350 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sytl5Q80T23 753 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Erlin2Q8BFZ9 340 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Best2Q8BGM5 508 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smarcal1Q8BJL0 910 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 PdhxQ8BKZ9 501 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd300ldQ8VCH2 221 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scamp5Q9JKD3 235 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cpxm1Q9Z100 722 aa12.29□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bpifb9bA2AJD1 591 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ssxb9A2BI93 185 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 BC049352E9Q2Z6 85 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Marcksl1P28667 200 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 ProcP33587 460 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mc4rP56450 332 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 WasP70315 520 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gdpd4Q3TT99 632 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtprjQ64455 1238 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pja2Q80U04 707 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bpifb9aQ80XI7 591 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fndc3aQ8BX90 1198 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8BZE1 841 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 AA792892Q8C6S1 278 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syn3Q8JZP2 579 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r64Q8R2B8 320 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc65Q8VHI7 493 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Erlin1Q91X78 346 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q922M7 232 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Unc45aQ99KD5 944 aa12.28□□□□□ -0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24 ms