Protein–RNA interactions for Protein: D3YYY1

Scgb2b7, ABPBG7, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b7D3YYY1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Scgb2b7D3YYY1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,26■■■■□ 3,4
Scgb2b7D3YYY1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Scgb2b7D3YYY1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Scgb2b7D3YYY1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,01■■■■□ 3,04
Scgb2b7D3YYY1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Scgb2b7D3YYY1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Scgb2b7D3YYY1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Scgb2b7D3YYY1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Scgb2b7D3YYY1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Scgb2b7D3YYY1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Scgb2b7D3YYY1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Scgb2b7D3YYY1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,6■■■□□ 2,81
Scgb2b7D3YYY1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Scgb2b7D3YYY1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Scgb2b7D3YYY1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Scgb2b7D3YYY1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,37■■■□□ 2,77
Scgb2b7D3YYY1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,09■■■□□ 2,73
Scgb2b7D3YYY1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Scgb2b7D3YYY1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Scgb2b7D3YYY1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Scgb2b7D3YYY1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Scgb2b7D3YYY1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Scgb2b7D3YYY1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Scgb2b7D3YYY1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Scgb2b7D3YYY1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,38■■■□□ 2,61
Scgb2b7D3YYY1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Scgb2b7D3YYY1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Scgb2b7D3YYY1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Scgb2b7D3YYY1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Scgb2b7D3YYY1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Scgb2b7D3YYY1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Scgb2b7D3YYY1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Scgb2b7D3YYY1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,2■■■□□ 2,59
Scgb2b7D3YYY1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Scgb2b7D3YYY1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Scgb2b7D3YYY1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
Scgb2b7D3YYY1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Scgb2b7D3YYY1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Scgb2b7D3YYY1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Scgb2b7D3YYY1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Scgb2b7D3YYY1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Scgb2b7D3YYY1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Scgb2b7D3YYY1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Scgb2b7D3YYY1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Scgb2b7D3YYY1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Scgb2b7D3YYY1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,38■■■□□ 2,45
Scgb2b7D3YYY1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Scgb2b7D3YYY1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Scgb2b7D3YYY1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Scgb2b7D3YYY1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Scgb2b7D3YYY1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Scgb2b7D3YYY1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Scgb2b7D3YYY1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Scgb2b7D3YYY1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Scgb2b7D3YYY1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Scgb2b7D3YYY1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Scgb2b7D3YYY1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Scgb2b7D3YYY1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Scgb2b7D3YYY1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Scgb2b7D3YYY1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Scgb2b7D3YYY1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Scgb2b7D3YYY1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Scgb2b7D3YYY1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,89■■■□□ 2,37
Scgb2b7D3YYY1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Scgb2b7D3YYY1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Scgb2b7D3YYY1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Scgb2b7D3YYY1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Scgb2b7D3YYY1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Scgb2b7D3YYY1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Scgb2b7D3YYY1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Scgb2b7D3YYY1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Scgb2b7D3YYY1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Scgb2b7D3YYY1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Scgb2b7D3YYY1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Scgb2b7D3YYY1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Scgb2b7D3YYY1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Scgb2b7D3YYY1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Scgb2b7D3YYY1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Scgb2b7D3YYY1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Scgb2b7D3YYY1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Scgb2b7D3YYY1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,25
Scgb2b7D3YYY1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Scgb2b7D3YYY1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Scgb2b7D3YYY1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Scgb2b7D3YYY1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Scgb2b7D3YYY1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Scgb2b7D3YYY1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Scgb2b7D3YYY1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Scgb2b7D3YYY1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Scgb2b7D3YYY1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Scgb2b7D3YYY1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Scgb2b7D3YYY1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Scgb2b7D3YYY1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Scgb2b7D3YYY1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Scgb2b7D3YYY1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Scgb2b7D3YYY1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Scgb2b7D3YYY1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Scgb2b7D3YYY1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Scgb2b7D3YYY1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,5 ms