Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Syne3Q4FZC9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Syne3Q4FZC9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Syne3Q4FZC9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Syne3Q4FZC9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Syne3Q4FZC9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Syne3Q4FZC9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Syne3Q4FZC9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Syne3Q4FZC9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Syne3Q4FZC9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Syne3Q4FZC9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Syne3Q4FZC9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Syne3Q4FZC9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Syne3Q4FZC9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Syne3Q4FZC9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Syne3Q4FZC9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Syne3Q4FZC9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Syne3Q4FZC9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Syne3Q4FZC9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Syne3Q4FZC9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Syne3Q4FZC9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Syne3Q4FZC9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Syne3Q4FZC9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Syne3Q4FZC9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Syne3Q4FZC9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Syne3Q4FZC9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Syne3Q4FZC9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Syne3Q4FZC9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Syne3Q4FZC9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Syne3Q4FZC9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Syne3Q4FZC9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Syne3Q4FZC9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Syne3Q4FZC9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Syne3Q4FZC9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Syne3Q4FZC9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Syne3Q4FZC9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Syne3Q4FZC9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Syne3Q4FZC9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Syne3Q4FZC9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Syne3Q4FZC9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Syne3Q4FZC9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Syne3Q4FZC9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Syne3Q4FZC9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Syne3Q4FZC9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Syne3Q4FZC9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Syne3Q4FZC9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Syne3Q4FZC9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Syne3Q4FZC9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Syne3Q4FZC9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Syne3Q4FZC9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Syne3Q4FZC9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Syne3Q4FZC9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Syne3Q4FZC9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Syne3Q4FZC9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Syne3Q4FZC9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Syne3Q4FZC9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Syne3Q4FZC9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Syne3Q4FZC9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Syne3Q4FZC9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Syne3Q4FZC9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Syne3Q4FZC9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Syne3Q4FZC9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Syne3Q4FZC9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Syne3Q4FZC9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Syne3Q4FZC9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Syne3Q4FZC9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Syne3Q4FZC9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Syne3Q4FZC9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Syne3Q4FZC9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Syne3Q4FZC9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Syne3Q4FZC9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Syne3Q4FZC9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Syne3Q4FZC9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Syne3Q4FZC9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Syne3Q4FZC9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Syne3Q4FZC9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Syne3Q4FZC9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Syne3Q4FZC9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Syne3Q4FZC9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Syne3Q4FZC9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Syne3Q4FZC9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Syne3Q4FZC9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Syne3Q4FZC9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Syne3Q4FZC9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Syne3Q4FZC9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Syne3Q4FZC9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Syne3Q4FZC9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Syne3Q4FZC9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Syne3Q4FZC9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Syne3Q4FZC9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syne3Q4FZC9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Syne3Q4FZC9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Syne3Q4FZC9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Syne3Q4FZC9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Syne3Q4FZC9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Syne3Q4FZC9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Syne3Q4FZC9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Syne3Q4FZC9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Syne3Q4FZC9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Syne3Q4FZC9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.5 ms