Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Pja2Q80U04 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
Pja2Q80U04 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Pja2Q80U04 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Pja2Q80U04 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Pja2Q80U04 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Pja2Q80U04 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Pja2Q80U04 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Pja2Q80U04 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Pja2Q80U04 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Pja2Q80U04 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Pja2Q80U04 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Pja2Q80U04 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Pja2Q80U04 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Pja2Q80U04 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Pja2Q80U04 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Pja2Q80U04 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,46■■■□□ 2,79
Pja2Q80U04 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
Pja2Q80U04 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Pja2Q80U04 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Pja2Q80U04 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Pja2Q80U04 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Pja2Q80U04 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Pja2Q80U04 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Pja2Q80U04 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Pja2Q80U04 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Pja2Q80U04 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Pja2Q80U04 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Pja2Q80U04 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Pja2Q80U04 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Pja2Q80U04 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Pja2Q80U04 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Pja2Q80U04 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Pja2Q80U04 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Pja2Q80U04 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Pja2Q80U04 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Pja2Q80U04 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Pja2Q80U04 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Pja2Q80U04 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Pja2Q80U04 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Pja2Q80U04 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Pja2Q80U04 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Pja2Q80U04 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Pja2Q80U04 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Pja2Q80U04 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Pja2Q80U04 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Pja2Q80U04 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
Pja2Q80U04 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Pja2Q80U04 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Pja2Q80U04 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Pja2Q80U04 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,32■■■□□ 2,44
Pja2Q80U04 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Pja2Q80U04 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Pja2Q80U04 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Pja2Q80U04 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Pja2Q80U04 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Pja2Q80U04 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Pja2Q80U04 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Pja2Q80U04 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Pja2Q80U04 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Pja2Q80U04 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Pja2Q80U04 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Pja2Q80U04 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Pja2Q80U04 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Pja2Q80U04 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Pja2Q80U04 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Pja2Q80U04 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Pja2Q80U04 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Pja2Q80U04 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Pja2Q80U04 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Pja2Q80U04 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Pja2Q80U04 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Pja2Q80U04 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Pja2Q80U04 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Pja2Q80U04 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Pja2Q80U04 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Pja2Q80U04 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Pja2Q80U04 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Pja2Q80U04 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Pja2Q80U04 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Pja2Q80U04 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Pja2Q80U04 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pja2Q80U04 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Pja2Q80U04 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Pja2Q80U04 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Pja2Q80U04 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Pja2Q80U04 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Pja2Q80U04 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Pja2Q80U04 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Pja2Q80U04 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Pja2Q80U04 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Pja2Q80U04 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Pja2Q80U04 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Pja2Q80U04 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pja2Q80U04 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pja2Q80U04 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pja2Q80U04 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Pja2Q80U04 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Pja2Q80U04 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Pja2Q80U04 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms