Protein–RNA interactions for Protein: P33587

Proc, Vitamin K-dependent protein C, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ProcP33587 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,46■■■■■ 4,39
ProcP33587 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
ProcP33587 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
ProcP33587 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,43■■■■□ 3,58
ProcP33587 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
ProcP33587 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
ProcP33587 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
ProcP33587 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
ProcP33587 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
ProcP33587 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
ProcP33587 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,3■■■■□ 3,24
ProcP33587 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,25■■■■□ 3,23
ProcP33587 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
ProcP33587 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
ProcP33587 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
ProcP33587 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
ProcP33587 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
ProcP33587 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,99■■■■□ 3,19
ProcP33587 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,72■■■■□ 3,15
ProcP33587 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
ProcP33587 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
ProcP33587 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,99■■■■□ 3,03
ProcP33587 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
ProcP33587 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
ProcP33587 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
ProcP33587 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
ProcP33587 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,48■■■□□ 2,95
ProcP33587 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
ProcP33587 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
ProcP33587 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
ProcP33587 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,12■■■□□ 2,89
ProcP33587 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
ProcP33587 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,03■■■□□ 2,88
ProcP33587 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33■■■□□ 2,87
ProcP33587 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
ProcP33587 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
ProcP33587 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
ProcP33587 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32,58■■■□□ 2,81
ProcP33587 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,57■■■□□ 2,8
ProcP33587 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
ProcP33587 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
ProcP33587 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
ProcP33587 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
ProcP33587 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
ProcP33587 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
ProcP33587 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
ProcP33587 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,28■■■□□ 2,76
ProcP33587 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
ProcP33587 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
ProcP33587 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,03■■■□□ 2,72
ProcP33587 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
ProcP33587 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
ProcP33587 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
ProcP33587 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
ProcP33587 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
ProcP33587 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,77■■■□□ 2,68
ProcP33587 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
ProcP33587 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
ProcP33587 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
ProcP33587 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,59■■■□□ 2,65
ProcP33587 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
ProcP33587 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,51■■■□□ 2,63
ProcP33587 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
ProcP33587 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
ProcP33587 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
ProcP33587 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
ProcP33587 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
ProcP33587 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
ProcP33587 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
ProcP33587 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
ProcP33587 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
ProcP33587 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,24■■■□□ 2,59
ProcP33587 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
ProcP33587 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
ProcP33587 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
ProcP33587 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,14■■■□□ 2,58
ProcP33587 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
ProcP33587 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
ProcP33587 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,05■■■□□ 2,56
ProcP33587 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,01■■■□□ 2,55
ProcP33587 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
ProcP33587 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
ProcP33587 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
ProcP33587 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
ProcP33587 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
ProcP33587 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
ProcP33587 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,78■■■□□ 2,52
ProcP33587 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
ProcP33587 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
ProcP33587 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
ProcP33587 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,7■■■□□ 2,51
ProcP33587 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
ProcP33587 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
ProcP33587 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
ProcP33587 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
ProcP33587 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
ProcP33587 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
ProcP33587 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
ProcP33587 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
ProcP33587 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,5 ms