RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		2.79	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		2.79	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.79	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	MPC3	P53311	146 aa		2.79	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	IRC21	Q04772	201 aa		2.79	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	PRM7	Q12459	698 aa		2.79	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	YLR111W	Q12528	110 aa		2.79	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.79	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	YKR073C	P36153	106 aa		2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	SHU1	P38751	150 aa		2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	SPG4	Q04438	115 aa		2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	YCR022C	P25620	114 aa		2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	YGL088W	P53151	121 aa		2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	FHN1	P53279	174 aa		2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	YNL190W	P53872	204 aa		2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		2.78	□□□□□ -1.96
XRS2	YDR369C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.77	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		2.77	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YGR018C	P53211	109 aa		2.77	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	ATP15	P21306	62 aa		2.76	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YFL015C	P43578	164 aa		2.76	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	OST5	Q92316	86 aa		2.76	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YAL064W	P39711	94 aa		2.76	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YMR122C	Q03879	124 aa		2.76	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	SED1	Q01589	338 aa		2.75	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YBL071C	P38185	102 aa		2.75	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		2.75	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
XRS2	YDR369C	TRS23	Q03784	219 aa		2.74	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		2.74	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	FYV5	P25585	152 aa		2.74	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	HSP150	P32478	413 aa		2.74	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YKL097C	P34245	136 aa		2.74	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
XRS2	YDR369C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YHL037C	P38733	133 aa		2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	KRE9	P39005	276 aa		2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YIL086C	P40503	102 aa		2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YPS5	P53057	165 aa		2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	RGM1	Q00453	211 aa		2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YPL278C	Q08990	100 aa		2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	QCR8	P08525	94 aa		2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	MRPL39	P36533	70 aa		2.73	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		2.72	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YER135C	P40082	130 aa		2.72	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YPR153W	Q06537	140 aa		2.72	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	RNH203	Q12338	110 aa		2.72	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YCR043C	P25361	127 aa		2.72	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	UTH1	P36135	365 aa		2.72	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		2.72	□□□□□ -1.97
XRS2	YDR369C	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YJR146W	P47174	117 aa		2.71	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YGR045C	P53229	120 aa		2.71	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YIR020C	P40575	100 aa		2.71	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	REE1	P40893	198 aa		2.71	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	ATP18	P81450	59 aa		2.7	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YMR244W	Q04018	355 aa		2.7	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	MRP10	O75012	95 aa		2.69	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	QCR10	P37299	77 aa		2.69	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	RRT1	P38192	103 aa		2.69	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		2.69	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YOL014W	Q08110	124 aa		2.67	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	HOT13	P36078	116 aa		2.67	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	RPR2	P40571	144 aa		2.67	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		2.66	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		2.65	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		2.65	□□□□□ -1.98
XRS2	YDR369C	HUB1	Q6Q546	73 aa		2.65	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	RPS27B	P38711	82 aa		2.64	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	YEL008W	P40001	126 aa		2.64	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	LIP1	Q03579	150 aa		2.64	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	SOM1	Q05676	74 aa		2.64	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		2.64	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		2.63	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		2.63	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		2.63	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	FYV12	Q08559	129 aa		2.63	□□□□□ -1.99
XRS2	YDR369C	YGL149W	P53116	101 aa		2.62	□□□□□ -1.99

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