RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523160.1

STAU2-223, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene STAU2, Length 227 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-223	ENST00000523160	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	HSPA4	P34932	840 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	PRPH	P41219	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	CAPZA2	P47755	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	GSK3A	P49840	483 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	HSD17B4	P51659	736 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	RCAN1	P53805	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	CTXN1	P60606	82 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	DDR1	Q08345	913 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	COX10	Q12887	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160		Q8NFD4	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	KRT35	Q92764	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	AK8	Q96MA6	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	UROC1	Q96N76	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160		A0A1W2PQ09	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	KRT87P	A6NCN2	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160		H0YAE9	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160		M0R082	166 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	ACOT7	O00154	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	PGRMC2	O15173	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	SEPT4	O43236	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	ENTPD3	O75355	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	RASSF9	O75901	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	VIP	P01282	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	OPN1MW	P04001	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	FUCA1	P04066	466 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	GNAI3	P08754	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	RAB6A	P20340	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	HOXC8	P31273	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	CIITA	P33076	1130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	GNAI1	P63096	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	PRAME	P78395	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	MGAT5	Q09328	741 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	IFT88	Q13099	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	NFIL3	Q16649	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-223	ENST00000523160	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms