RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 TTC8Q8TAM2 541 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 EBF3Q9H4W6 596 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 HPS4Q9NQG7 708 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM30AQ9NV96 361 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 CXCL12P48061 93 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 USP4Q13107 963 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 CPA6Q8N4T0 437 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB44Q8NCP5 570 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP2A3Q93084 1043 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNK16Q96T55 309 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 IL37Q9NZH6 218 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRDP23468 1912 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 PSMA7O14818 248 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 AP1G2O75843 785 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 OLFM2O95897 454 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 IFNAR2P48551 515 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 MXI1P50539 228 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 NR1H3Q13133 447 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 CCINQ13939 588 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 PON2Q15165 354 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 SNX30Q5VWJ9 437 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 TNFRSF10BO14763 440 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM68Q6AZZ1 485 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 RIN3Q8TB24 985 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO32Q969P5 355 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ECT2Q9H8V3 914 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT82Q9NSB4 513 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB20Q9NX57 234 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM92AA1XBS5 289 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ABL1P00519 1130 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 OAS1P00973 400 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ARSAP15289 507 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 TUBP50607 506 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC5A3P53794 718 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR44Q5JSH3 913 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 OBSL1O75147 1896 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDSP1-211ENST00000492545 DMDP11532 3685 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 CILPO75339 1184 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM200BP0CF97 657 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 EML3Q32P44 896 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 C12orf29Q8N999 325 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 RNF38Q9H0F5 515 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP54Q96N23 3096 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 LEFTY2O00292 366 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 LILRB5O75023 590 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 ATG13O75143 517 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 NFATC1O95644 943 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 TDGF1P13385 188 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC130P13994 396 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 DRD1P21728 446 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 GAS6Q14393 721 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 HECTD3Q5T447 861 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 CYFIP2Q96F07 1278 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP63Q96MT8 703 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 SMOQ99835 787 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 PATJQ8NI35 1801 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 HOXA6P31267 233 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 GJA4P35212 333 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDSP1-211ENST00000492545 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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