RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490051.1

GRB10-222, Transcript of growth factor receptor bound protein 10, human

TSL 4

Gene GRB10, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRB10-222	ENST00000490051	ACD	Q96AP0	544 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	RNF38	Q9H0F5	515 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051		A8MXQ7	604 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	CUTA	O60888	179 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	PPP6R2	O75170	966 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	BCKDHB	P21953	392 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	TAF10	Q12962	218 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	ORC1	Q13415	861 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	CUL4B	Q13620	913 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	PSMD6	Q15008	389 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	IGF2R	P11717	2491 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	UBE4B	O95155	1302 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GRB10-222	ENST00000490051	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051		K7EQS6	105 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SLC6A11	P48066	632 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CDH8	P55286	799 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	EHHADH	Q08426	723 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	NR1H3	Q13133	447 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	BIRC3	Q13489	604 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TRPC3	Q13507	836 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	EDEM2	Q9BV94	578 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24	3e-9	■■■■■ 64.1
GRB10-222	ENST00000490051	EXOC3	O60645	756 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PHACTR2	O75167	634 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TACC1	O75410	805 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	AKAP3	O75969	853 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	YEATS4	O95619	227 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	IRF1	P10914	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TCF3	P15923	654 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TIE1	P35590	1138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PDE6C	P51160	858 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	AMPD3	Q01432	767 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PKP1	Q13835	747 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ELF2	Q15723	593 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	LOXL4	Q96JB6	756 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	OLFM2	O95897	454 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CCDC130	P13994	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ME1	P48163	572 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SLC7A9	P82251	487 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	DHCR24	Q15392	516 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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