RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438141.5

TTLL3-215, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,743 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-215	ENST00000438141	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	ARC	Q7LC44	396 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	BRCA2	P51587	3418 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	GRAP2	O75791	330 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	RARG	P13631	454 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	ATF2	P15336	505 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	ADORA2B	P29275	332 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	RAB27A	P51159	221 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	SCNN1G	P51170	649 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	SNX16	P57768	344 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	LMNB2	Q03252	620 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	RNF180	Q86T96	592 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-215	ENST00000438141	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ATP2C2	O75185	946 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ITGAV	P06756	1048 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	HOXD10	P28358	340 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	CLCNKB	P51801	687 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ITGA8	P53708	1063 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	SENP8	Q96LD8	212 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	CST8	O60676	142 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	CAND2	O75155	1236 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	TRPA1	O75762	1119 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	PTPN9	P43378	593 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ACADSB	P45954	432 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	CAV1	Q03135	178 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	UPP1	Q16831	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	TEKT4	Q8WW24	435 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	SHBG	P04278	402 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	SDC4	P31431	198 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	CHKA	P35790	457 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ADCY8	P40145	1251 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	VPS41	P49754	854 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	HDAC4	P56524	1084 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	SKOR1	P84550	965 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ATP11A	P98196	1134 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	DPYSL3	Q14195	570 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	CDO1	Q16878	200 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	LHX8	Q68G74	356 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-215	ENST00000438141	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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