RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376726.3

ACSS1-202, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ACSS1, Length 2,244 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-202ENST00000376726 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 APBA2Q99767 749 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 CALN1Q9BXU9 219 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 HESX1Q9UBX0 185 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 A8MXQ7 604 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 HCRTO43612 131 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 KCNE1P15382 129 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 MORF4L2Q15014 288 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 C10orf88Q9H8K7 445 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa25.47■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 SPTLC1O15269 473 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 GABBR2O75899 941 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 ENDOD1O94919 500 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 ATP5DP30049 168 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 PDE4CQ08493 712 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 CDO1Q16878 200 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC14Q49A88 953 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 IFNL1Q8IU54 200 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 SCUBE3Q8IX30 993 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 CFAP57Q96MR6 1250 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 RSAD1Q9HA92 442 aa25.46■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 KPNA7A9QM74 516 aa25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 APOC2P02655 101 aa25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 SLC6A3Q01959 620 aa25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 SLC20A2Q08357 652 aa25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 SESTD1Q86VW0 696 aa25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 NME8Q8N427 588 aa25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 C7orf31Q8N865 590 aa25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.67
ACSS1-202ENST00000376726 DPYSL4O14531 572 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 FGFR1P11362 822 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 HOXC8P31273 242 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 GDF10P55107 478 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 STK32AQ8WU08 396 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 CABS1Q96KC9 395 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 SAYSD1Q9NPB0 183 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 IPPQ9Y573 584 aa25.45■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 PRPSAP2O60256 369 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 PDGFRBP09619 1106 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 GNAT1P11488 350 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 CDH6P55285 790 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 ATP11AP98196 1134 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 MMRN1Q13201 1228 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 ZNF560Q96MR9 790 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 GDAP2Q9NXN4 497 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 FSBPO95073 299 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 ABHD2P08910 425 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 CREB1P16220 341 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 VSTM1Q6UX27 236 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 CRYBG2Q8N1P7 616 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.44■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 NDC80O14777 642 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC130P13994 396 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 LMO2P25791 158 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 STAT4Q14765 748 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 PACS2Q86VP3 889 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 RSAD2Q8WXG1 361 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 PNPLA4P41247 253 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 SNX16P57768 344 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 DPYSL3Q14195 570 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC142Q17RM4 750 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 TAF6P49848 677 aa25.42■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 RGMBQ6NW40 437 aa25.42■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa25.42■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 UNC45BQ8IWX7 931 aa25.42■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 LRRC34Q8IZ02 419 aa25.42■■□□□ 1.66
ACSS1-202ENST00000376726 CYP4X1Q8N118 509 aa25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms